结论：不定工时工作制下，工作时间超过12小时且没有加班费的情况是否合法，需根据具体情况判断。一般情况下，即使实行不定工时制，超出法定工作时间部分仍应支付加班费，且每日工作时间一般不应超过法定上限。以下从不同角度详细分析：
一、不定工时工作制的定义与适用范围
不定工时工作制，也称为不定时工作制，是针对因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的一种工时制度。根据《劳动法》及相关规定，不定工时工作制主要适用于以下岗位：
- 企业中的高级管理人员、外勤人员、推销人员、部分值班人员和其他因工作无法按标准工作时间衡量的职工；
- 企业中的长途运输人员、出租汽车司机和铁路、港口、仓库的部分装卸人员以及因工作性质特殊，需机动作业的职工；
- 其他因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，适合实行不定时工作制的职工。
二、不定工时工作制下的工作时间与加班费
工作时间限制：
- 即使实行不定工时工作制，职工的工作时间也应受到合理限制，以保障其休息权和健康权。虽然不定工时制不严格限制每日的具体工作时间，但并不意味着可以无限制地延长工作时间。
- 根据《劳动法》的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。对于实行不定工时制的职工，虽然每日工作时间可能不固定，但平均每日和每周的工作时间仍应符合这一基本要求。
加班费支付：
- 在不定工时工作制下，如果职工的工作时间超出了法定工作时间（如每日超过八小时或每周超过四十四小时），且这种超出是由于工作需要而非职工自愿，那么用人单位应支付加班费。
- 加班费的计算通常根据职工的基本工资和加班时间来确定，具体标准可能因地区和行业而有所不同。一般来说，工作日加班的加班费不低于工资的百分之一百五十，休息日加班且不能安排补休的加班费不低于工资的百分之二百，法定节假日加班的加班费不低于工资的百分之三百。
三、特殊情况下的工作时间与加班费
综合计算工时工作制：
- 有些企业可能实行综合计算工时工作制，即以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
- 在综合计算工时工作制下，如果职工在一个计算周期内的总工作时间超过了法定标准工作时间，那么超出部分应视为加班，用人单位应支付加班费。
特殊行业或岗位的特殊规定：
- 某些特殊行业或岗位（如医疗、交通、能源等）可能因工作性质特殊而需要实行更灵活的工作时间制度。在这些情况下，用人单位应遵守相关法律法规和行业规定，确保职工的工作时间和休息权得到保障。
- 如果这些特殊行业或岗位实行了不定工时工作制，并且得到了劳动行政部门的批准，那么职工的工作时间可能不受每日八小时或每周四十四小时的限制。但是，这并不意味着用人单位可以无限制地延长工作时间而不支付加班费。
四、法律建议与风险提示
法律建议：
- 如果您所在的企业实行不定工时工作制，并且您的工作时间经常超过12小时且没有加班费，建议您首先与企业沟通协商，要求企业按照法律规定支付加班费或调整工作时间。
- 如果沟通协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉举报，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
风险提示：
- 长时间超负荷工作可能对您的身体健康造成严重影响，甚至引发职业病或工伤事故。因此，在维护自己合法权益的同时，也要关注自己的身体健康状况。
- 在申请劳动仲裁或提起诉讼时，要保留好相关证据（如工作记录、考勤表、工资单等），以便证明自己的主张和诉求。
最后，不定工时工作制并不意味着可以无限制地延长工作时间而不支付加班费。如果您遇到类似情况，请及时向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。