可以申请加班费。公司没有备案不定时工作制，但实际工作性质属于不定时工作制的情况下，员工仍然有权根据实际情况申请加班费。以下是详细分析：

1. 不定时工作制与加班费的关系：

   • 不定时工作制是指因工作性质、特点或工作职责的限制，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的弹性工时制度。
   • 即便公司未备案不定时工作制，若员工实际上按照不定时工作制的工作模式进行工作，且存在加班事实，那么员工仍有权要求支付加班费。

2. 加班费的计算与申请：

   • 加班费的计算通常基于员工的工资标准、加班时长以及加班性质（如平日加班、休息日加班、法定节假日加班等）来确定。
   • 员工在申请加班费时，应提供加班的证据，如加班记录、工作日志、邮件往来等，以证明加班事实的存在。

3. 公司未备案的法律后果：

   • 公司未备案不定时工作制可能面临劳动行政部门的处罚，但这并不影响员工申请加班费的权利。
   • 若因公司未备案导致员工无法享受应有的加班待遇，员工有权向劳动行政部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

综上所述，即便公司没有备案不定时工作制，但员工实际工作性质属于不定时工作制且存在加班事实的情况下，员工仍然有权申请加班费。在申请过程中，员工应提供充分的加班证据，并了解相关的法律程序和规定，以确保自己的权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。