员工自己生病无法参与工作，合同到期时公司不续签合同，公司是否需要赔偿需依据具体情况分析，主要考虑医疗期内、医疗期满后及是否因工致残等不同情形，以下是详细分析：
一、医疗期内劳动合同的处理
不可终止劳动合同：
- 根据《劳动合同法》第四十二条，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得依据该法第四十条（无过失性辞退）或第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。这意味着，在医疗期内，即使劳动合同到期，公司也不得直接终止合同。
合同续延：
- 依据《劳动合同法》第四十五条，劳动合同期满时，若职工仍处于医疗期内，劳动合同应续延至医疗期结束或相应情形消失时终止。因此，公司需等待医疗期结束后再考虑是否续签合同。
违法解除的赔偿：
- 若公司在医疗期内违法解除劳动合同（如提前终止合同且未支付相应赔偿），劳动者有权要求继续履行合同；若合同无法继续履行或劳动者不要求继续履行，公司应按经济补偿标准的二倍支付赔偿金，即每工作一年支付两个月工资。
二、医疗期满后劳动合同的处理
合法解除与经济补偿：
- 医疗期满后，若公司选择不续签劳动合同且不属于违法解除（如员工已恢复健康且能胜任工作，但公司因业务调整等原因不续签），则需按《劳动合同法》第四十七条的规定支付经济补偿金。计算标准为：每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
月工资确定：
- 经济补偿金中的“月工资”指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，且受当地职工月平均工资三倍的限制。即，若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
三、额外医疗补助费
- 适用条件：对于非因工患病且经劳动鉴定委员会确认不能从事原工作或公司另行安排的工作的员工，除经济补偿金外，公司还应支付不低于六个月工资的医疗补助费。患重病和绝症的，还需增加相应的医疗补助费。这一规定体现了对患病员工的特殊关怀和保障。
四、因工致残的特殊处理
总结与建议：在处理员工生病期间公司不续签合同的赔偿问题时，应首先明确员工是否处于医疗期内，以及医疗期满后的具体情况。同时，需考虑员工是否因工致残等因素，以确定公司应承担的法律责任和经济赔偿标准。若您面临此类问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。