结论前置：休息时间在办公室吃饭被罚款是否违法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若公司规章制度未明确规定禁止在办公室吃饭或未将此行为列为罚款事项：

   • 根据《劳动合同法》及相关劳动法规，公司对员工进行罚款需有明确的规章制度依据，且该规章制度需经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商等），并向员工公示或告知。若公司规章制度中未明确禁止在办公室吃饭，或未将此行为列为可罚款事项，则公司对员工进行罚款缺乏法律依据，属于违法行为。员工有权拒绝缴纳罚款，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身合法权益。

2. 若公司规章制度明确规定禁止在办公室吃饭，并将此行为列为罚款事项，且该规章制度经过民主程序制定并公示或告知员工：

   • 在这种情况下，公司对员工在办公室吃饭的行为进行罚款，从形式上看似乎符合规章制度的要求。然而，仍需进一步审查该罚款规定是否合理。根据《劳动合同法》及相关规定，公司对员工的罚款应限于员工因故意或重大过失给公司造成经济损失的情况，且罚款金额不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。若公司仅因员工在办公室吃饭这一轻微违规行为就进行罚款，且罚款金额不合理或违反上述限制，则该罚款行为仍可能被认定为违法。员工同样有权拒绝缴纳不合理罚款，并可通过法律途径维权。

3. 特殊情况考虑：

   • 若公司因特殊原因（如食品安全、卫生要求等）临时禁止在办公室吃饭，并提前通知了员工，但员工仍违反规定在办公室吃饭，公司可能依据临时规定对员工进行一定程度的处理。但这种处理仍应遵循合理性原则，且不应违反劳动法律法规关于罚款的限制。若公司处理方式不当或罚款金额不合理，员工仍有权维权。

建议：若您遇到休息时间在办公室吃饭被罚款的情况，首先应查看公司规章制度中是否有相关规定，并确认该规章制度是否经过民主程序制定并公示或告知了员工。若公司罚款行为缺乏依据或不合理，您有权拒绝缴纳罚款，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。