工伤和自身疾病混在一起治疗时，赔偿需根据具体情况分情况处理，核心原则是区分工伤医疗费用与自身疾病医疗费用，分别按照工伤保险和医疗保险的相关规定进行赔偿。以下是具体分析：

1. 工伤医疗费用部分

   • 赔偿原则：若治疗中包含因工伤直接引发的医疗费用，如工伤导致的伤口处理、手术、药品等，这部分费用应由工伤保险基金或用人单位承担。根据《工伤保险条例》第三十条，治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。
   • 操作建议：患者或家属应保留所有与工伤治疗相关的医疗票据、诊断证明、用药清单等，以便后续申请工伤保险赔偿时作为证据。

2. 自身疾病医疗费用部分

   • 赔偿原则：若治疗中包含与工伤无关的自身疾病，如患者本身患有高血压、糖尿病等慢性疾病，且这些疾病的治疗与工伤无直接关联，则这部分费用应按照医疗保险的相关规定进行报销。若患者未参加医疗保险或医疗保险报销不足，则需自行承担剩余费用。
   • 操作建议：对于自身疾病的治疗，患者应同样保留好相关医疗票据和诊断证明，以便向医疗保险机构申请报销。若医疗保险报销比例较低或存在自费部分，患者需做好经济准备。

3. 难以区分的医疗费用部分

   • 赔偿原则：在实际治疗中，可能存在部分医疗费用既与工伤有关，又与自身疾病有关，如某些药物既可用于治疗工伤伤口感染，又可用于控制患者自身疾病。对于这部分费用，需由医疗机构出具证明，明确各项费用的具体用途和比例，然后按照工伤保险和医疗保险的相关规定进行分摊赔偿。
   • 操作建议：患者或家属应积极与医疗机构沟通，要求其出具详细的费用明细和证明，以便后续申请赔偿时能够准确区分工伤医疗费用和自身疾病医疗费用。

总结与建议：工伤和自身疾病混在一起治疗时，赔偿的关键在于准确区分工伤医疗费用和自身疾病医疗费用。患者或家属应保留好所有相关医疗票据和诊断证明，积极与医疗机构和保险机构沟通，确保赔偿申请的顺利进行。若遇到复杂情况或争议，建议及时向我咨询，以便获得更专业的法律帮助。