事业单位一般不会仅因员工患有艾滋病而开除员工。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律法规层面
《中华人民共和国劳动法》与《中华人民共和国劳动合同法》：
- 这两部法律明确规定了劳动者享有平等的就业和选择职业的权利，以及取得劳动报酬、享受社会保险和福利等权利。同时，也规定了用人单位不得解除劳动合同的情形，其中包括劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的。
- 艾滋病患者并不属于因工负伤或职业病范畴，但若其处于医疗期内，且未严重违反用人单位规章制度或不能胜任工作等法定解除情形，用人单位不得随意解除劳动合同。
《艾滋病防治条例》：
- 该条例明确规定，任何单位和个人不得歧视艾滋病病毒感染者、艾滋病病人及其家属。艾滋病病毒感染者、艾滋病病人及其家属享有的婚姻、就业、就医、入学等合法权益受法律保护。
- 事业单位作为用人单位，必须遵守这一规定，不得因员工患有艾滋病而开除或歧视。
二、事业单位内部规章制度层面
规章制度合法性：
- 事业单位的内部规章制度必须符合国家法律法规的规定，不得与法律法规相抵触。若规章制度中存在歧视艾滋病患者的条款，该条款将因违法而无效。
规章制度执行：
- 即使事业单位内部规章制度中有关于员工健康状况的规定，也必须确保这些规定不违反国家法律法规的强制性规定。在执行过程中，事业单位应尊重和保护员工的合法权益，不得因员工患有艾滋病而违反规定进行开除。
三、实际操作与建议
沟通与协商：
- 若事业单位对员工患有艾滋病的情况存在担忧或疑虑，建议首先与员工进行沟通与协商，了解员工的健康状况和需求，共同寻找解决方案。
提供必要支持：
- 事业单位应为患有艾滋病的员工提供必要的医疗支持和心理关怀，帮助员工积极面对疾病，保持工作积极性和稳定性。
遵守法律法规：
- 事业单位在处理员工患有艾滋病的情况时，必须严格遵守国家法律法规的规定，不得因员工患有艾滋病而开除或歧视。否则，将可能面临法律责任和声誉损失。
总结来看，事业单位一般不会仅因员工患有艾滋病而开除员工。若遇到相关问题或有进一步疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。