在交通事故中自己负主要责任且受伤的情况下，公司是否会开基本工资，需视是否被认定为工伤而定。具体分析如下：
一、一般情况下，负主要责任不符合工伤认定情形
根据法律规定，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故伤害的，应当认定为工伤。若职工在交通事故中负主要责任，通常不符合上述工伤认定情形。这意味着，在一般情况下，如果职工在交通事故中负主要责任，那么该事故可能不会被认定为工伤，因此公司可能不会按照工伤待遇来支付工资。
二、存在特殊情况，可能被认定为工伤
虽然职工负主要责任，但事故是由于不可预见、不可避免的原因导致，且符合其他工伤认定条件的，有可能被认定为工伤。例如，如果事故是由于突发疾病、车辆故障等不可预见的原因导致的，即使职工负主要责任，也可能被认定为工伤。
三、若被认定为工伤，停工留薪期内工资待遇不变
若被认定为工伤，职工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。这意味着，如果职工被认定为工伤，并且在停工留薪期内，那么公司需要按照职工的原工资福利待遇来支付工资。
四、具体判定需由劳动行政部门依据程序进行
具体是否属于工伤，需结合实际情况，由劳动行政部门依据工伤认定程序判定。这包括对事故现场的勘查、对相关证据的收集和分析、对职工受伤情况的评估等。因此，如果职工在交通事故中受伤，并且希望获得工伤待遇，那么需要及时向劳动行政部门申请工伤认定。
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