结论：罚款2000元是否合适，需结合具体法律规定、公司规章制度以及员工行为的性质、后果等因素综合判断，不能一概而论。
一、从法律规定角度分析
罚款的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，用人单位对员工进行罚款需有明确的法律依据或规章制度支持，且该规章制度需经过民主程序制定并公示。若公司规章制度中未明确规定此类行为的罚款标准，或罚款标准过高，可能面临法律风险。
罚款的合理性：
- 罚款金额应与员工行为的性质、后果相适应。员工拿走店里价值500元的东西，虽然已追回，但行为本身具有违法性或违规性。然而，罚款2000元是否合理，需考虑该金额是否超出了员工行为可能造成的损失或影响，以及是否符合公司内部的奖惩制度。
二、从公司规章制度角度分析
规章制度的内容：
- 公司应制定明确的规章制度，规定员工行为的奖惩标准。若规章制度中明确规定了此类行为的罚款金额，且该金额合理合法，则公司有权按照规章制度执行。
规章制度的执行：
- 公司在执行规章制度时，应确保程序的公正性和透明性。罚款前应告知员工罚款的理由、依据和金额，并给予员工申辩的机会。若公司未按照规章制度执行罚款，或罚款程序存在瑕疵，可能引发劳动争议。
三、从员工行为性质及后果角度分析
员工行为的性质：
- 员工拿走店里东西的行为，可能构成盗窃或违反公司规章制度。根据行为的性质，公司可以采取相应的纪律处分措施，包括警告、罚款、解雇等。
员工行为的后果：
- 虽然物品已追回，但员工的行为可能对公司造成一定的负面影响，如损害公司形象、影响员工士气等。公司在考虑罚款金额时，应综合考虑这些因素。
四、建议与措施
审查公司规章制度：
- 公司应审查其规章制度，确保其中关于罚款的规定合法、合理且明确。若规章制度存在瑕疵或不明确之处，应及时进行修订和完善。
与员工沟通协商：
- 在决定罚款前，公司应与员工进行沟通协商，了解员工的行为动机和背景情况。通过沟通协商，可以更好地解决问题，避免不必要的劳动争议。
考虑替代性措施：
- 除了罚款外，公司还可以考虑采取其他替代性措施，如警告、记过、降职等。这些措施可以根据员工行为的性质和后果进行灵活选择和应用。
若您对此类问题还有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。