农民工一般不可以直接通过劳动仲裁向发包人主张工程款，但存在例外情形。以下从不同角度进行分析：
一、常规情况：农民工与发包人无直接劳动关系
在大多数情况下，农民工是受雇于承包人（如施工队、建筑公司等），与发包人（即工程业主或建设单位）之间并不存在直接的劳动关系。根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动仲裁主要适用于解决用人单位与劳动者之间因劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等发生的争议。由于农民工与发包人之间无直接劳动关系，因此，农民工通常不能直接通过劳动仲裁向发包人主张工程款。
二、例外情形：发包人存在过错或违法分包等
尽管常规情况下农民工不能直接劳动仲裁发包人，但存在一些例外情形，使得农民工可能间接或直接向发包人主张权益：
发包人违法分包或转包：
- 如果发包人将工程违法分包或转包给不具备相应资质的单位或个人，导致农民工工资无法得到保障，根据相关法律法规，发包人可能需要承担连带责任。
- 在这种情况下，农民工虽然不能直接通过劳动仲裁向发包人主张工资，但可以通过法律途径（如诉讼）要求发包人在欠付工程款范围内承担支付责任。
发包人直接雇佣农民工：
- 如果发包人直接雇佣农民工进行工作，并与之建立了事实上的劳动关系，那么农民工与发包人之间就存在了直接的劳动关系。
- 在这种情况下，农民工当然有权通过劳动仲裁向发包人主张劳动报酬等权益。不过，这种情况在现实中较为少见。
政府或相关部门介入：
- 在某些情况下，政府或相关部门可能会介入解决农民工工资问题，特别是当发包人存在严重过错或违法行为时。
- 政府或相关部门可能会要求发包人直接支付农民工工资，或者通过其他方式保障农民工的权益。
三、建议与措施
收集证据：
- 农民工应尽可能收集与发包人、承包人之间的合同、工作记录、工资单等证据，以证明自己的工作情况和应得报酬。
寻求法律援助：
- 农民工可以咨询专业律师（如我），了解自己的法律权益和可行的维权途径。
- 律师可以根据具体情况，为农民工提供法律建议和帮助，包括起草法律文书、参与谈判或诉讼等。
通过合法途径维权：
- 农民工应通过合法途径维权，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。
- 避免采取过激行为或非法手段，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。
如果有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。