女职工在签完协商离职申请后发现怀孕，通常情况下并不享有特殊的补偿权利。但这一问题涉及多个层面，以下是详细的分析：

1. 协商离职的效力：

   • 根据《劳动合同法》第三十六条，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。这种协商解除通常具有法律效力。

2. 孕期女职工的特殊保护：

   • 《劳动合同法》第四十二条明确规定了用人单位不得因特定原因（如第四十条、第四十一条）解雇孕期女职工。然而，这并不排除双方协商一致解除劳动合同的可能性，但应确保协商过程中不存在欺诈、胁迫或重大误解。

3. 重大误解的认定与处理：

   • 如果女职工在协商解除劳动合同时不知道自己已怀孕，且这一事实影响了其真实意思表示，那么可能构成重大误解。在此情况下，女职工有权请求撤销协商离职协议，并可能要求恢复劳动关系或获得相应的赔偿。

4. 赔偿情况：

   • 如果协商离职协议被撤销，且女职工要求恢复劳动关系，用人单位应当恢复其劳动关系，并按照正常工资标准支付工资。
   • 如果劳动合同无法继续履行或女职工选择不继续，她可以要求用人单位支付赔偿金。赔偿金的计算通常依据《劳动合同法》第四十七条规定的经济补偿标准的二倍来进行。

5. 实际操作建议：

   • 女职工在发现怀孕后，应尽快与用人单位沟通，说明情况，并请求恢复劳动关系或协商合理的补偿方案。
   • 如果用人单位拒绝恢复劳动关系或提供合理补偿，女职工可以在一年内申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，女职工在签完协商离职申请后发现怀孕，并不直接享有特殊的补偿权利。但如果协商过程中存在重大误解或用人单位明知故犯，女职工有权要求恢复劳动关系或获得相应赔偿。在处理此类问题时，建议女职工及时与用人单位沟通，并寻求专业法律支持以确保维权的成功。