结论前置：协议里没有明确工作时间和加班费，是可以申请劳动仲裁的。以下从多个角度为你详细分析：
法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：
- （二）因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议；
- （五）因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议。
工作时间和加班费属于劳动合同中的重要内容，也是劳动报酬的组成部分。如果协议中没有明确这些内容，导致劳动者与用人单位之间产生了争议，那么这就属于劳动争议调解仲裁法的调整范围，劳动者有权申请劳动仲裁。
具体分析
工作时间未明确：
- 劳动合同中应当明确约定工作时间，这是劳动者的基本权益之一。如果协议中没有明确工作时间，用人单位可能随意安排劳动者的工作时间，包括加班等，这将严重侵犯劳动者的休息权和健康权。
- 在这种情况下，劳动者可以向劳动仲裁机构申请仲裁，要求用人单位明确工作时间，并可能要求用人单位支付因未明确工作时间而导致的加班费等损失。
加班费未明确：
- 加班费是劳动者在超出正常工作时间外工作所应得的报酬。如果协议中没有明确加班费的计算方式和支付标准，用人单位可能拒绝支付或低额支付加班费，这将损害劳动者的经济利益。
- 劳动者同样可以向劳动仲裁机构申请仲裁，要求用人单位按照法律规定支付加班费。根据《劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
- （一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
- （二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
- （三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
申请劳动仲裁的流程与建议
准备证据：
- 劳动者在申请劳动仲裁前，应当收集并整理好与争议有关的证据，如劳动合同、工作记录、加班通知、工资条等。这些证据将有助于证明劳动者与用人单位之间存在劳动关系，以及用人单位未明确工作时间和加班费的事实。
提交仲裁申请：
- 劳动者可以向当地的劳动仲裁机构提交仲裁申请，并附上相关证据。仲裁申请应当明确载明劳动者的仲裁请求、事实和理由等。
参与仲裁程序：
- 在仲裁过程中，劳动者应当积极参与，如实陈述事实，提供证据，并遵守仲裁程序的规定。仲裁机构将根据双方提供的证据和陈述，作出公正的裁决。
寻求法律帮助：
- 如果劳动者在申请劳动仲裁过程中遇到困难或问题，可以随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
最后，协议里没有明确工作时间和加班费是可以通过劳动仲裁来维护自己的合法权益的。如果你遇到了类似的问题，不要犹豫，及时申请劳动仲裁，并准备好相关证据，以维护自己的合法权益。