房地产企业根据备案情况核减土地使用税面积，在符合相关法律法规和政策规定的前提下，是合法的。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、法律法规依据
《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》：
- 该条例是土地使用税征收与核减的基本法规，明确规定土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据。对于房地产企业而言，随着开发项目的销售，其实际占用的土地面积会相应减少，因此应纳税额也应随之核减。
《财政部、国家税务总局关于房产税、城镇土地使用税有关问题的通知》（财税〔2008〕152号）：
- 该通知规定，房产、土地实物或权利状态发生变化时，纳税义务终止，税款计算截止至变化当月末。这意味着，当房地产企业将开发的商品房交付给业主后，对应的土地使用权实际上已部分转移，企业实际占用的土地面积减少，因此可以对土地使用税进行核减。
二、核减的具体操作与条件
房屋交付与纳税义务：
- 房地产企业销售新建商品房时，自房屋交付使用之次月起计征城镇土地使用税。房屋交付后，对应土地的使用权转移，企业应及时申请核减土地使用税。
备案情况与核减依据：
- 备案情况通常作为土地使用税核减的重要依据。企业需根据房屋销售情况、土地面积变化等实际情况进行备案，并向税务部门提供相关证明材料（如房屋交付证明、土地面积变化证明等），以申请土地使用税的核减。
地方实施细则与计算方法：
- 地方税务部门会根据实际情况制定具体的计算方法，如按照房屋销售面积占总可售面积的比例来确定已售房屋对应的土地面积，进而核减土地使用税。企业需遵循当地税务部门的规定进行操作。
三、合法核减的注意事项
合规操作：
- 企业在申请土地使用税核减时，必须确保所有操作均符合相关法律法规和政策规定。任何违规操作都可能导致税务风险，甚至面临法律处罚。
及时沟通：
- 企业应保持与税务部门的沟通，及时了解最新政策和通知，确保合规操作。在申请核减过程中，如遇到问题或疑问，应及时向税务部门咨询并寻求指导。
完整记录：
- 企业应完整记录房屋销售情况、土地面积变化等关键信息，并妥善保存相关证明材料。这些记录和证明材料是申请土地使用税核减的重要依据，也是应对税务检查的重要资料。
四、可能存在的风险与应对
风险：
- 如果企业未按照规定进行备案或申请核减，或者提供的证明材料不真实、不完整，可能导致税务部门不予核减或要求补缴税款及滞纳金。
应对：
- 企业应加强内部管理，确保房屋销售情况、土地面积变化等关键信息的准确记录和及时备案。同时，加强与税务部门的沟通与合作，确保合规操作并降低税务风险。
总结来说，房地产企业根据备案情况核减土地使用税面积是合法的，但必须确保所有操作均符合相关法律法规和政策规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。