机关单位替岗是否合法，需分情况讨论，具体如下：
若替岗行为符合内部规章制度且未违反法律法规：
- 机关单位内部可能因工作需要、人员调配等原因，存在替岗的情况。如果这种替岗行为是按照单位内部的规章制度进行的，且没有违反国家相关的法律法规，那么这种替岗行为通常是合法的。例如，单位内部有明确的替岗流程，替岗人员具备相应的资质和能力，且替岗期间的工作安排和责任划分都清晰明确，这样的替岗行为就是合法的。
若替岗行为违反法律法规或内部规章制度：
- 如果替岗行为违反了国家相关的法律法规，或者违反了机关单位内部的规章制度，那么这种替岗行为就是不合法的。例如，替岗人员不具备相应的资质或能力，导致工作出现失误或事故；或者替岗行为未经单位同意，擅自进行，这些都可能构成违法行为或违规行为。
- 特别地，如果替岗行为涉及到劳动关系的变更或解除，如未经劳动者同意擅自安排他人替岗并解除原劳动者劳动关系，这种行为可能违反《劳动合同法》等相关法律法规，劳动者有权依法维护自己的合法权益。
法律建议：
- 对于机关单位而言，应建立健全内部规章制度，明确替岗的流程和要求，确保替岗行为的合法性和合规性。同时，应加强对替岗人员的培训和管理，提高其工作能力和素质，确保替岗期间的工作质量和安全。
- 对于劳动者而言，如果遇到机关单位擅自安排他人替岗的情况，应首先与单位进行沟通协商，了解替岗的原因和安排。如果认为替岗行为侵犯了自己的合法权益，可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果机关单位的替岗行为被认定为违法或违规，可能会面临劳动监察部门的处罚或劳动者的法律诉讼。这可能导致单位需要承担经济赔偿责任、行政处罚责任等，甚至可能影响单位的声誉和形象。
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