结论：劳动合同中签订同工同酬，但实际发放工资却按照小时工计算，这种做法是否违法，需结合具体情况判断。若劳动者与用人单位建立的是全日制劳动关系，却按小时工标准支付工资，则属于违法行为；若双方建立的是非全日制劳动关系，且符合非全日制用工的相关规定，则按小时计酬并不违法。
一、全日制劳动关系下的违法性分析
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十六条：“工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。”这意味着，在同一工作岗位上，付出相同劳动量的劳动者，应获得相同的劳动报酬。
- 同时，《中华人民共和国劳动合同法》第二十条也规定：“劳动者在试用期的工资不得低于本单位相同岗位最低档工资或者劳动合同约定工资的百分之八十，并不得低于用人单位所在地的最低工资标准。”这一条款进一步强调了工资支付的公平性和合理性。
违法情形：
- 若劳动者与用人单位建立的是全日制劳动关系，即劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时，且用人单位与劳动者签订的是全日制劳动合同，但实际却按小时工标准支付工资，这明显违反了同工同酬的原则和劳动合同的约定。
- 在这种情况下，劳动者有权要求用人单位按照劳动合同约定的工资标准支付工资，并可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
二、非全日制劳动关系下的合法性分析
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第六十八条：“非全日制用工，是指以小时计酬为主，劳动者在同一用人单位一般平均每日工作时间不超过四小时，每周工作时间累计不超过二十四小时的用工形式。”
- 同时，该法第七十二条也规定：“非全日制用工小时计酬标准不得低于用人单位所在地人民政府规定的最低小时工资标准。”
合法情形：
- 若劳动者与用人单位建立的是非全日制劳动关系，即劳动者每日工作时间不超过四小时、每周工作时间累计不超过二十四小时，且双方约定按小时计酬，那么这种做法是合法的。
- 在这种情况下，用人单位只需按照双方约定的小时工资标准支付工资，且该标准不得低于当地政府规定的最低小时工资标准。
三、建议与提醒
对于劳动者：
- 在签订劳动合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于工资支付的部分，确保自己的权益得到保障。
- 若发现用人单位存在违法支付工资的行为，应及时收集证据并向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于用人单位：
- 应严格遵守相关法律法规，按照劳动合同约定的工资标准支付工资，避免违法风险。
- 若需采用非全日制用工形式，应确保符合相关法律法规的规定，并与劳动者明确约定工作时间、工资标准等事项。
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