结论：小时工工资扣款与同工同酬工资的处理是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 同工同酬原则的适用：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国劳动法》第四十六条，工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。这意味着，在同一单位内，从事相同工作、付出等量劳动且取得相同劳动业绩的劳动者，应获得相同的劳动报酬。
   • 分析：如果小时工与正式员工从事相同的工作，且劳动量和劳动成果相同，那么小时工应获得与正式员工相同的工资待遇。若单位对小时工进行扣款，导致其实际工资低于同工同酬的标准，则可能构成违法。

2. 工资扣款的合法性：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，《工资支付暂行规定》也明确规定了工资支付的相关要求，包括不得克扣工资等。
   • 分析：如果单位对小时工的工资进行扣款，必须基于合法的理由，如劳动者违反单位规章制度、造成经济损失等，并且扣款金额应合理，不得超过法定限额。若单位无正当理由扣款，或扣款金额过高，则可能构成违法。

3. 小时工工资的特殊性：

   • 法律背景：小时工通常属于非全日制员工，其工资支付方式、工作时间等可能与全日制员工有所不同。根据《中华人民共和国劳动合同法》第七十二条，非全日制用工小时计酬标准不得低于用人单位所在地人民政府规定的最低小时工资标准。
   • 分析：对于小时工而言，其工资应至少达到当地最低小时工资标准。如果单位在支付工资时，既考虑了同工同酬的原则，又确保了小时工的工资不低于最低小时工资标准，那么即使对小时工进行了一定的扣款（如基于合法理由的扣款），也可能不构成违法。但关键在于扣款是否合法、合理，并且是否影响了小时工的最低工资保障。

法律建议：

• 如果您作为小时工，认为单位对您的工资扣款不合理或违法，您可以先与单位进行沟通协商，要求单位提供扣款的合法依据和计算方式。
• 如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
• 在处理此类纠纷时，建议您保留好相关的证据材料，如工资条、扣款通知、工作记录等，以便在需要时提供证明。

可能法律后果：

• 如果单位被认定存在违法扣款行为，可能需要承担补发工资、支付赔偿金等法律责任。
• 同时，单位的违法行为还可能受到劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。