结论：工资按小时计算的情况下，扣工时是否合法，需根据具体情况判断，主要看扣工时的原因是否符合法律规定以及劳动合同或公司规章制度的约定。

分析说明：

1. 合法扣工时的情况：

   • 员工迟到、早退或旷工：如果员工因个人原因迟到、早退或旷工，公司按照规章制度扣除相应工时，这是合法的。因为员工没有提供完整的劳动时间，公司有权根据实际出勤情况支付工资。
   • 员工请假：员工因私事或病假等需要请假，公司根据请假制度扣除相应工时，也是合法的。这种情况下，员工没有提供劳动，公司无需支付相应时间的工资。
   • 公司规章制度或劳动合同约定：如果公司规章制度或劳动合同中明确规定了某些情况下可以扣除工时（如员工违反公司规定、工作失误造成损失等），并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣除工时也是合法的。

2. 非法扣工时的情况：

   • 无合法理由扣除：如果公司没有合法理由，如员工没有违反任何规定或没有请假等情况下，公司随意扣除工时，这是非法的。员工有权要求公司支付被扣除工时的工资。
   • 扣除工时超过法定限度：即使公司有合法理由扣除工时，但如果扣除的工时超过了法定限度（如一个月内扣除的工时过多，导致员工工资低于当地最低工资标准等），这也是非法的。公司应确保扣除工时后，员工的工资仍然符合法律法规的规定。

法律建议：

• 员工方面：如果员工认为公司扣除工时不合法，可以先与公司沟通协商，要求公司说明扣除工时的理由和依据。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 公司方面：公司在扣除员工工时时，应确保有合法理由，并且扣除的工时符合法律法规和公司规章制度的规定。同时，公司应建立健全的考勤制度和工资支付制度，确保员工的权益得到保障。

后续行动：

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• 在处理此类问题时，建议保留好相关证据（如考勤记录、工资条、劳动合同等），以便在需要时提供证明。