结论：公司给员工按小时算工资，在离职时扣工资是否合法，需根据具体情况判断，若公司扣工资有合法依据且符合法定程序，则是合法的；若没有合法依据或违反法定程序，则是不合法的。以下从不同角度进行分析：
一、合法扣工资的情形
法定扣减：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 举例：若员工因疏忽导致公司财产损失，公司根据劳动合同约定要求员工赔偿，且每月扣除的工资未超过员工当月工资的20%，同时扣除后员工工资不低于当地最低工资标准，则这种扣工资行为是合法的。
约定扣减：
- 如果公司与员工在劳动合同中明确约定了离职时可能扣除工资的情形（如未提前通知离职、未完成工作交接等），且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣工资也是合法的。
- 举例：劳动合同中约定，员工离职需提前30天通知公司，否则将扣除一个月工资的10%作为违约金。若员工未提前通知即离职，公司按照约定扣除工资，这种行为在合同约定合法的前提下是合法的。
二、非法扣工资的情形
无合法依据扣减：
- 如果公司扣工资没有合法依据，如仅因员工离职就随意扣减工资，或者扣减的工资数额超过了法定或约定的范围，那么这种行为就是非法的。
- 举例：公司以员工离职为由，未经员工同意就扣除其一个月工资，且没有劳动合同约定或法律法规支持，这种行为就是非法的。
违反法定程序扣减：
- 即使公司有合法依据扣减工资，但如果未按照法定程序进行，如未提前告知员工、未听取员工申辩等，也可能构成非法扣工资。
- 举例：公司因员工造成经济损失要扣工资，但未提前告知员工扣工资的具体数额和依据，也未听取员工的申辩，就直接从工资中扣除，这种行为可能因违反法定程序而被认定为非法。
三、法律建议
- 审查劳动合同：员工应仔细审查与公司的劳动合同，了解其中关于工资扣减的约定是否合法合规。
- 保留证据：若公司扣工资，员工应保留相关证据，如工资条、扣款通知等，以便在必要时维护自己的合法权益。
- 协商解决：员工可先与公司协商解决扣工资问题，若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
若你遇到公司非法扣工资的情况，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。