公安机关刑事立案三年后又撤销立案，这一行为是有明确的法律依据的，主要基于案件侦查过程中发现的特定情形。以下是对此问题的详细解析：

1. 撤销案件的法律依据：

   • 根据《公安机关办理刑事案件程序规定》，公安机关在侦查过程中，若发现案件存在特定情形，如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，未告诉或撤回告诉的；犯罪嫌疑人死亡的；以及其他法律规定免予追究刑事责任的，应当撤销案件。这些规定为公安机关在立案后撤销案件提供了明确的法律依据。

2. 撤销案件的程序要求：

   • 撤销案件并非随意为之，而是需要遵循严格的法律程序。首先，承办人员需提出撤销案件的意见，并撰写撤销案件报告，详述案情、立案依据、侦查过程及撤销理由。其次，报告需提交办案部门负责人审核，确保撤销决定有充分依据。最后，经县级以上公安机关负责人批准后，才能正式作出撤销决定，并制作撤销案件决定书，及时送达相关人员。

3. 立案三年后撤销的合理性：

   • 立案三年后撤销案件，并不意味着公安机关的行为违法或不当。在长时间的侦查过程中，公安机关可能发现了新的证据或情况，导致原立案的依据不再成立。例如，原本认为构成犯罪的行为，在进一步侦查后发现情节显著轻微、危害不大，不构成犯罪；或者犯罪嫌疑人死亡，导致诉讼程序无法继续。在这些情况下，公安机关依法撤销案件是合理的。

4. 撤销案件后的处理：

   • 撤销案件后，公安机关还需进行一系列后续处理。如解除查封、扣押、冻结的财物及其孳息，并及时返还给所有人（除非另有法律和规定要求处理）。同时，保障相关当事人的知情权和合法权益，如及时通知犯罪嫌疑人（在押者立即释放并发给释放证明书）、被害人或其近亲属、法定代理人以及举报人等利害关系人。

5. 重新立案的可能性：

   • 值得注意的是，撤销案件并不意味着案件永远终结。若公安机关在撤销案件后发现新证据或事实证明原撤销决定错误，仍可重新立案侦查。这体现了司法程序的灵活性和公正性。

总结来看，公安机关刑事立案三年后又撤销立案，是依法进行的程序，必须确保司法公正和当事人的合法权益。若您对具体案件中的撤销立案决定有疑问或不满，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。