结论前置：工厂在员工急辞时扣全部底薪的行为通常是不合理的，可能违反了相关劳动法律法规。
法律背景与解释：
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及《工资支付暂行规定》，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，除非有法定或约定的扣除情形，否则用人单位不得随意扣除劳动者的工资。
急辞与工资扣除：
- 员工急辞（即未提前通知用人单位而突然离职）可能给用人单位带来一定的损失，如招聘替代人员的成本、工作交接的困难等。然而，这并不意味着用人单位可以随意扣除员工的全部底薪。
- 用人单位若因员工急辞而遭受损失，应当通过合法途径主张赔偿，如与员工协商、提起劳动仲裁或诉讼等，而不是直接扣除工资。
合法扣除的情形：
- 根据相关法律法规，用人单位在特定情况下可以扣除劳动者的工资，如劳动者因个人原因给用人单位造成经济损失的、违反用人单位规章制度被罚款的（但罚款金额需合理且符合法律规定）、劳动者需支付的社会保险费用个人承担部分等。然而，这些扣除情形都需要有明确的法律依据或劳动合同约定，并且扣除的金额应当合理。
法律建议：
与用人单位协商：
- 如果您认为工厂扣除全部底薪的行为不合理，首先可以尝试与用人单位进行协商，说明您的立场和理由，争取达成一个合理的解决方案。
申请劳动仲裁：
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求用人单位支付被扣除的工资。在申请劳动仲裁时，您需要提供相关证据，如劳动合同、工资条、扣除工资的证明等。
寻求法律援助：
- 如果您对劳动仲裁程序不熟悉或担心自己的权益得不到保障，可以寻求法律援助或咨询专业律师（比如我，郭凯文律师，专注于劳动纠纷等领域），以获取更专业的法律帮助。
可能的法律后果：
- 如果工厂扣除全部底薪的行为被认定为违法，那么工厂可能需要承担支付被扣除工资、赔偿劳动者损失等法律责任。同时，工厂还可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。
总结与进一步思考：
- 工厂在员工急辞时扣全部底薪的行为通常是不合理的，可能违反了相关劳动法律法规。作为劳动者，您有权维护自己的合法权益，通过协商、劳动仲裁或法律诉讼等途径来争取被扣除的工资。
- 在未来的工作中，建议您尽量提前与用人单位沟通离职事宜，以便用人单位有足够的时间进行工作交接和招聘替代人员，从而减少因急辞而可能产生的纠纷和损失。
如果您有任何进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请随时向我咨询。