结论：在工厂上班工资结清且已离开公司半年，但未签任何书面协议的情况下，您仍然有可能进行申诉，但具体能否成功取决于多种因素，包括申诉事项的性质、证据的充分性以及时效问题等。
分析：
申诉事项的性质：
- 如果您申诉的是与工资、加班费、经济补偿等劳动报酬相关的问题，且这些权益在您离职时并未得到妥善解决或存在争议，那么您有权进行申诉。
- 如果您申诉的是与劳动合同签订、社会保险缴纳等劳动权益相关的问题，虽然未签订书面协议，但根据《劳动合同法》等相关法律法规，用人单位与劳动者之间仍存在事实劳动关系，您同样有权进行申诉。
证据的充分性：
- 在申诉过程中，证据是关键。您需要提供能够证明您与用人单位之间存在劳动关系、以及您所申诉事项的具体情况的证据，如工作证、工资条、考勤记录、同事证言等。
- 由于您未签订书面协议，因此更需要通过其他证据来证明劳动关系的存在和申诉事项的合理性。
时效问题：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
- 您已离开公司半年，但并未超过一年的仲裁时效期间，因此从时效角度来看，您仍然有权进行申诉。不过，如果涉及某些特定权益（如工伤保险待遇等），可能存在更短的时效限制，需要具体分析。
建议：
- 尽快准备证据：收集并整理能够证明您与用人单位之间存在劳动关系以及申诉事项具体情况的证据。
- 咨询专业律师：由于劳动纠纷涉及复杂的法律法规和程序，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
- 及时提出申诉：在准备好证据并咨询律师后，尽快向当地劳动争议仲裁委员会提出申诉，以免错过时效期间。
可能后果：
- 如果申诉成功，您可能获得相应的经济补偿或赔偿，以及用人单位可能被要求改正违法行为。
- 如果申诉失败，您可能需要承担一定的诉讼费用，并且无法获得预期的补偿或赔偿。不过，这并不意味着您完全无路可走，您还可以考虑通过其他途径（如民事诉讼）来维护自己的权益。
额外提醒：
- 在未来的工作中，建议您尽量与用人单位签订书面劳动合同，以明确双方的权利和义务，减少纠纷的发生。
- 如果遇到劳动纠纷，及时咨询专业律师并采取行动，以维护自己的合法权益。
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