没有签劳动合同，员工自己离职且工资已结清的情况下，员工仍然有可能起诉你，但具体是否会被起诉以及起诉的结果，取决于多个因素。以下是对此问题的详细分析：
一、可能引发诉讼的原因
未签订劳动合同的双倍工资差额
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。如果员工在离职后意识到这一权益，并认为用人单位未依法支付双倍工资差额，可能会选择通过法律途径主张权利。
其他劳动争议
- 除了未签订劳动合同的问题外，还可能存在其他劳动争议，如加班费争议、社会保险缴纳问题、解除劳动关系经济补偿金等。如果员工对这些问题有异议，并认为自己的合法权益受到侵害，同样可以提起劳动仲裁或诉讼。
二、员工起诉的可行性及结果
仲裁时效
- 员工需要在知道或应当知道自己的权益受到侵害之日起一年内提出仲裁申请。如果超过仲裁时效，可能会丧失胜诉权。因此，你需要关注员工是否在时效期内提出仲裁或诉讼。
证据收集
- 员工需要提供充分的证据证明自己的主张，如工作记录、工资条、考勤表、同事证言等。如果证据不足，可能会影响案件的审理结果。作为用人单位，你也需要准备相关证据来反驳员工的主张。
法院审理
- 法院会根据双方提供的证据和法律规定进行审理。如果员工的主张成立，法院可能会判决你承担相应的法律责任，如支付双倍工资差额、加班费、经济补偿金等。
三、法律建议
及时补签劳动合同
- 为了避免类似的法律纠纷，建议你尽快与员工补签书面劳动合同，明确双方的权利和义务。
保留相关证据
- 在日常管理中，注意保留与员工相关的证据，如工资发放记录、考勤记录、工作交接单等。这些证据在发生劳动争议时可能起到关键作用。
积极应对诉讼
- 如果员工提起诉讼，你需要积极应对，准备相关证据和材料，按照法律程序进行答辩和举证。必要时，可以寻求专业律师的帮助来维护你的合法权益。
总结来看，即使员工已经离职且工资已结清，但如果存在未签订劳动合同等违法行为，员工仍然有可能通过法律途径获得赔偿。因此，作为用人单位，你需要严格遵守相关法律法规，及时与员工签订书面劳动合同，并妥善处理与员工之间的劳动争议。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。