结论前置：员工因涉及违纪提出离职，单位在一般情况下不可以不同意，但在特定情形下，如员工离职可能给单位造成重大损失等，单位可能有权要求员工继续履行合同或采取其他措施。以下从不同角度进行分析：
一、员工主动离职的法律规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工有权主动提出离职。通常情况下，员工提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内，员工提前三日通知用人单位，也可以解除劳动合同。这是员工的基本权利，单位一般应当尊重并配合办理离职手续。
二、单位不同意离职的特定情形
尽管员工有权主动离职，但在某些特定情形下，单位可能不同意员工离职：
员工掌握单位核心机密或关键业务：如果员工掌握单位的核心机密或关键业务，其离职可能给单位造成重大损失。在这种情况下，单位可能依据相关法律法规或劳动合同中的保密条款、竞业限制条款等，要求员工继续履行合同或采取其他措施保护单位利益。但这种情况需要单位有充分的证据证明员工的离职将给单位造成重大损失，并且需要遵循法律程序进行。
员工未履行提前通知义务：如果员工未按照法律规定或劳动合同约定的期限提前通知单位就擅自离职，单位有权要求员工承担违约责任，并可能不同意其离职申请。但这种情况下，单位仍然需要按照法律规定为员工办理离职手续，只是可以就员工的违约行为主张相应的赔偿。
劳动合同中有特殊约定：如果劳动合同中有特殊约定，如员工在特定期间内不得离职等，且该约定不违反法律法规的强制性规定，单位可能依据合同约定不同意员工离职。但这种情况较为少见，且需要合同条款明确、合法、有效。
三、单位不同意离职的法律后果
如果单位无正当理由不同意员工离职，员工可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求单位办理离职手续并支付相应的经济补偿。劳动争议仲裁委员会将根据事实和法律规定进行裁决，维护员工的合法权益。
四、建议与措施
对于员工：在提出离职前，应仔细阅读劳动合同和单位规章制度，了解离职的相关规定和程序。按照法律规定和合同约定提前通知单位，并办理好离职手续。如果单位不同意离职，可以与单位协商解决或依法申请仲裁。
对于单位：应尊重员工的离职权利，按照法律规定和合同约定为员工办理离职手续。如果员工离职可能给单位造成重大损失，可以与员工协商解决或依法采取其他措施保护单位利益。同时，单位也应完善劳动合同和规章制度，明确离职的相关规定和程序，以减少纠纷的发生。
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