结论：关于公司上班每个月有2天假，一共休了5天是扣5天还是扣2天的问题，这主要取决于公司的具体规章制度以及您与公司之间的劳动合同约定。以下是从不同角度进行的分析：

1. 公司规章制度与劳动合同约定：

   • 若规章制度或合同明确：如果公司的规章制度或您与公司签订的劳动合同中明确规定了每月的休假天数以及超出休假天数的处理方式（如扣工资、调休等），那么应当按照这些规定或约定来执行。例如，如果合同规定每月休假2天，超出部分按事假处理并扣减相应工资，那么您休了5天，超出3天，就应当扣减这3天的工资。
   • 若规章制度或合同未明确：如果公司的规章制度或劳动合同中没有明确规定超出休假天数的处理方式，那么公司不能随意扣减您的工资。在这种情况下，您可以与公司进行协商，寻求合理的解决方案。

2. 法律法规的考量：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有休息休假的权利。但是，具体的休假天数和方式通常由用人单位根据实际情况制定，并应与劳动者协商一致。因此，在处理此类问题时，应首先参考公司的规章制度和劳动合同。
   • 如果公司的规章制度或劳动合同中的规定违反了法律法规的强制性规定（如低于法定最低休假天数），那么这些规定是无效的，您有权要求公司按照法律法规的规定执行。

3. 实际操作建议：

   • 查阅合同与制度：首先，建议您查阅自己的劳动合同和公司的规章制度，了解关于休假天数的具体规定。
   • 与公司沟通：如果合同或制度中有明确规定，但您认为不合理或存在疑问，可以与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，寻求解释或协商解决方案。
   • 保留证据：在沟通过程中，建议您保留好相关的证据（如合同、制度、沟通记录等），以备不时之需。
   • 寻求法律援助：如果公司坚持不合理扣减工资，且您无法通过沟通解决问题，可以考虑寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。

举例说明：假设您与公司签订的劳动合同中规定每月休假2天，超出部分按事假处理并扣减相应工资。如果您在某个月休了5天假，那么根据合同规定，您超出了3天的休假天数。这3天应当被视为事假，并按照公司的工资计算方式扣减相应的工资。

特殊情况：如果公司存在特殊情况（如业务繁忙、人员短缺等），需要临时调整休假安排，应当与您进行协商并达成一致意见。如果未经协商擅自调整休假安排并扣减工资，可能构成违法行为。

总之，在处理此类问题时，建议您首先查阅合同和制度、与公司沟通、保留好相关证据，并在必要时寻求法律援助。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。