结论：单位员工在上下班途中发生交通事故死亡且负次要责任，一般是可以被认定为工伤的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《工伤保险条例》第十四条的规定，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。这一条款明确指出了在上下班途中发生交通事故，且职工不承担主要责任时，可以认定为工伤。
二、关键要素解析
上下班途中：
- “上下班途中”指的是职工在合理的上下班时间和合理的上下班路线上遭受伤害。合理时间包括正常下班时间以及加班后下班的时间等；合理路线则涵盖从工作地直接到家的路径，以及下班途中顺便从事合理、必要活动的路线，如顺路买菜等，只要这些活动没有使路线明显偏离正常的回家路径。
非本人主要责任：
- 在交通事故中，职工承担的责任若为同等责任、次要责任或无责任，均满足“非本人主要责任”的条件。这意味着，即使职工在事故中负有一定责任，只要不是主要责任，就有可能被认定为工伤。
三、工伤认定流程与所需材料
申请流程：
- 如果符合上述条件，职工的近亲属可以在事故伤害发生之日起1年内，向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
所需材料：
- 工伤认定申请表；
- 与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料；
- 医疗诊断证明或职业病诊断证明书（若适用）；
- 交通事故责任认定书等相关证据。
四、单位责任与赔偿
工伤保险缴纳情况：
- 若单位已为员工缴纳工伤保险，则由工伤保险基金负责赔偿相关费用，包括医疗费、误工费、护理费等。若员工因工伤死亡，其近亲属可获得丧葬补助金、供养亲属抚恤金和一次性工亡补助金等。
- 若单位未为员工缴纳工伤保险，则需按照工伤保险的相关规定自行承担赔偿责任，包括上述所有费用。
赔偿标准：
- 丧葬补助金为6个月的统筹地区上年度职工月平均工资。
- 一次性工亡补助金为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。
- 供养亲属抚恤金按照职工本人工资的一定比例发给由因工死亡职工生前提供主要生活来源、无劳动能力的亲属。
五、特殊情况与注意事项
- 非合理路线与时间：若员工并非在合理的下班路线和时间内发生交通事故，如去办理私人事务期间发生事故，这种情况可能无法认定为工伤，单位一般不承担工伤赔偿责任。
- 及时报警与责任认定：事故发生后，应第一时间报警并获取交警部门出具的责任认定书，这是后续工伤认定的重要依据。
- 向单位报告与申请工伤认定：及时向所在单位报告事故情况，并按照规定程序申请工伤认定。若单位未在规定时间内申报，员工或其家属需自行向相关部门申请。
总结与建议：
综上所述，单位员工在上下班途中发生交通事故死亡且负次要责任，一般是可以被认定为工伤的。在申请工伤认定时，应确保提供完整、真实的申请材料，并遵循规定的流程。同时，也应注意到工伤认定可能受到的其他因素影响，如员工的劳动关系是否真实存在、是否参加了工伤保险等。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。