员工在上班路上发生交通事故且负次要责任，通常情况下是应当被认定为工伤的，但用户提出“为什么不是工伤”的疑问，可能涉及对工伤认定条件的误解或特殊情况的考量，以下从多个角度进行分析：
一、工伤认定的基本条件
根据《工伤保险条例》第十四条第六项的规定，职工在上下班途中，若受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害，应当认定为工伤。这里的“非本人主要责任”包括本人负次要责任、同等责任等情况，是以公安机关交通管理部门出具的事故责任认定书为依据的。因此，如果交通事故责任认定书中明确职工在该起事故中负次要责任，那么就符合“非本人主要责任”的条件，应当被认定为工伤。
二、可能不被认定为工伤的特殊情况
尽管在大多数情况下，员工在上班路上发生交通事故且负次要责任会被认定为工伤，但也存在一些特殊情况可能导致不被认定为工伤，例如：
事故责任认定存在争议：如果员工对交通事故责任认定书的结果有异议，认为责任划分不准确或存在错误，那么可能需要通过法律途径进行复核或申诉。在责任认定结果未明确之前，工伤认定可能会受到影响。
事故发生时间或路线不合理：工伤认定要求事故必须发生在合理的上下班时间和合理的上下班路途中。如果员工在下班后先去处理私事再回家，或者选择了非正常的上下班路线，那么在这段期间发生的交通事故可能不被视为发生在“上下班途中”，从而不被认定为工伤。
存在其他免责情形：根据《工伤保险条例》的规定，如果员工存在故意犯罪、醉酒或者吸毒、自残或者自杀等行为导致的事故伤害，那么即使发生在上下班途中，也不会被认定为工伤。
三、工伤认定的流程与材料
如果员工在上班路上发生交通事故且负次要责任，并希望申请工伤认定，那么需要按照以下流程进行：
提交工伤认定申请：职工或其近亲属、用人单位应在事故发生之日起一年内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。申请时需提供工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系的证明材料、医疗诊断证明或者职业病诊断证明书等材料。特别需要注意的是，还需提供公安机关交通管理部门出具的事故责任认定书，以证明员工在事故中负次要责任。
审核与认定：社会保险行政部门受理工伤认定申请后，将根据提交的材料和调查情况进行审核。如果符合工伤认定的条件，将作出工伤认定的决定。
四、建议与总结
对于员工而言，在上班路上发生交通事故且负次要责任时，应及时咨询当地社保部门或向我咨询，以便更好地了解自己的权益并启动工伤认定程序。同时，保留好所有相关的证据和文件，如交通事故责任认定书、医疗记录等，以备不时之需。
综上所述，员工在上班路上发生交通事故且负次要责任，在大多数情况下是应当被认定为工伤的。但如果存在事故责任认定争议、事故发生时间或路线不合理、存在其他免责情形等特殊情况，则可能不被认定为工伤。因此，在具体案件中，需要综合考虑多种因素来确定是否符合工伤认定的条件。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。