您承包的果园被他人挖了大坑，这属于土地权益受侵害的情况，可优先向当地国土资源管理部门（或自然资源局）反映，同时根据具体情形，也可向农业农村部门或公安机关寻求帮助。以下是详细分析：

1. 国土资源管理部门（或自然资源局）
   果园土地属于农业用地或集体建设用地，其使用权受《土地管理法》保护。若他人未经许可挖坑破坏土地原状，可能涉嫌非法改变土地用途或破坏耕地（若涉及基本农田则情节更严重）。国土部门负责土地资源监管，有权责令恢复原状、罚款，甚至追究刑事责任（如构成非法占用农用地罪）。

2. 农业农村部门
   若果园属于家庭农场、合作社等新型农业经营主体，或涉及农业设施用地（如灌溉设施被破坏），农业农村部门可依据《农业法》《农村土地承包法》介入，协调处理承包经营权纠纷，督促侵权方赔偿损失。

3. 公安机关
   若挖坑行为伴随故意毁坏财物（如果树、灌溉系统被破坏），且损失金额达到当地刑事立案标准（通常5000元以上），可向公安机关报案，追究对方故意毁坏财物罪的刑事责任；若未达刑事标准，也可要求按《治安管理处罚法》处以行政拘留或罚款。

行动建议：

• 第一步：固定证据
  立即拍照、录像记录坑洞位置、大小及周边损害情况，保留承包合同、土地权属证明等文件，必要时委托第三方机构评估损失。
  
• 第二步：书面投诉
  向当地国土资源局提交《土地侵权投诉书》，明确侵权时间、地点、方式及诉求（如恢复土地、赔偿损失），附上证据材料。
  
• 第三步：同步报案
  若存在财物毁坏，携带证据向派出所报案，要求出具《受案回执》，推动刑事/行政程序。
  
• 第四步：民事索赔
  若部门协调无果，可向法院提起民事诉讼，依据《民法典》第1165条（过错责任原则）要求侵权方停止侵害、赔偿损失。
  

提示：若对方是政府征地或公共项目施工，需核实是否取得合法征地手续；若为邻里纠纷，可优先通过村委会调解，降低维权成本。如有进一步细节（如侵权方身份、损失金额等），可向我补充说明，我会为您分析具体应对策略。