在城市规划区内的一般农用地上进行违法建设，通常由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门负责查处。以下是对这一问题的详细分析：

1. 查处主体：

   • 根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门负责本行政区域内的城乡规划管理工作，包括查处违法建设行为。在城市规划区内的一般农用地上进行违法建设，属于城乡规划管理的范畴，因此应由城乡规划主管部门负责查处。

2. 查处依据：

   • 城乡规划主管部门在查处违法建设时，主要依据《中华人民共和国城乡规划法》以及地方性的城乡规划条例或规定。这些法律法规明确了违法建设的定义、查处程序、处罚措施等，为城乡规划主管部门提供了执法依据。

3. 查处程序：

   • 城乡规划主管部门在发现违法建设行为后，通常会进行立案调查，收集相关证据，确认违法事实。
   • 随后，会向违法建设者发出责令停止建设通知书或限期改正通知书，要求其停止违法行为或限期改正。
   • 如果违法建设者拒不执行，城乡规划主管部门可以依法采取强制措施，如拆除违法建筑等。

4. 特殊情况：

   • 如果违法建设行为同时涉及土地管理、农业管理等领域，城乡规划主管部门可能会与相关部门进行联合执法，共同查处违法行为。
   • 在某些地区，可能还设有专门的违法建设查处机构或联合执法机制，负责统一协调和处理违法建设问题。

5. 法律后果：

   • 违法建设者可能面临罚款、拆除违法建筑、恢复原状等法律后果。
   • 如果违法建设行为情节严重，构成犯罪的，还可能依法追究刑事责任。

建议：

• 如果您发现城市规划区内的一般农用地上存在违法建设行为，可以向当地县级以上地方人民政府城乡规划主管部门举报或投诉。
• 在进行建设活动时，务必遵守相关法律法规和城乡规划要求，避免违法建设行为的发生。

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