关于农用地上违建属于什么部门管辖的问题，我可以为你提供详细的解答。

结论前置：农用地上违建的管理涉及多个政府部门，主要包括乡（镇）人民政府、县级自然资源部门以及县级农业农村部门，它们各自依据相关法律法规承担不同的管理职责。

1. 乡（镇）人民政府：

   • 乡（镇）人民政府在农村违规建筑管理中扮演重要角色，负责乡村规划的组织实施和监督管理工作。
   • 根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，对未依法取得乡村建设规划许可证或未按许可证规定进行建设的行为，乡（镇）人民政府有权责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可拆除违规建筑。

2. 县级自然资源部门：

   • 县级自然资源部门负责土地资源和城乡规划管理，对农村违规建筑中涉及违反土地利用总体规划、非法占用农用地等行为进行查处。
   • 依据《中华人民共和国土地管理法》等法规，自然资源部门有权责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占地上新建的建筑物和其他设施。

3. 县级农业农村部门：

   • 县级农业农村部门专注于农村宅基地管理，对违规占用宅基地建房、超标准多占宅基地等问题进行监督和查处。
   • 根据相关规定，农业农村部门负责农村宅基地改革和管理有关工作，对未经批准或采取欺骗手段骗取批准，非法占用宅基地建住宅的行为，可依法进行处理。

综合说明：

• 在实际操作中，若发现农用地上存在违建，应及时向相关部门反映和举报。通常情况下，可以先向当地自然资源部门报告，由其进行初步调查和认定。
• 若违建涉及乡村规划或宅基地管理问题，也可同时向乡（镇）人民政府或农业农村部门寻求协助。
• 各部门在处理农用地上违建时，应严格遵循法律法规，确保执法行为的合法性和公正性，保护农民的合法权益，促进农村社会的和谐稳定。

希望以上解答能对你有所帮助。如果你还有其他法律问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。