企业如果配合员工把不是工伤的情况申请认定为工伤，将会面临一系列严重的法律后果和潜在风险，具体分析如下：
承担不实的工伤待遇费用：
- 一旦非工伤情况被错误认定为工伤，企业将需要承担原本不应由其承担的工伤待遇费用。这包括但不限于医疗费用、停工留薪期工资、一次性伤残补助金等。这些费用原本应由工伤保险基金支付，但由于企业的错误申请，将转由企业自行承担，无疑增加了企业的经济负担。
面临行政处罚：
- 企业如果故意或过失地配合员工进行虚假的工伤认定申请，可能构成对《工伤保险条例》等法律法规的违反。劳动保障行政部门在发现此类行为后，有权对企业进行行政处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。这不仅会给企业带来直接的经济损失，还会损害企业的声誉和形象。
影响企业信誉和内部管理：
- 企业配合员工进行虚假的工伤认定申请，一旦被发现，将严重损害企业的信誉。员工、合作伙伴以及社会公众可能对企业产生不信任感，进而影响企业的业务发展和市场竞争力。此外，这种行为还可能破坏企业内部的公平和正义原则，影响员工的士气和团队的凝聚力，不利于企业的长期稳定发展。
可能涉及刑事责任：
- 在极端情况下，如果企业配合员工进行虚假的工伤认定申请，且涉及金额较大或情节严重，可能构成诈骗罪等刑事犯罪。一旦企业或相关责任人被追究刑事责任，将面临严厉的刑罚处罚，包括有期徒刑、罚金等。
法律建议：
- 企业应严格遵守相关法律法规，确保工伤认定的真实性和准确性。在员工发生事故伤害或被诊断为职业病后，企业应及时、如实地为员工申请工伤认定，避免因为错误申请而承担不必要的法律责任和经济负担。
- 如果企业对工伤认定存在疑问或争议，应及时咨询专业律师或相关机构，以确保自身权益得到保障。
举例说明：
- 假设某企业员工在工作中不慎摔倒，但并未造成严重伤害，也不符合工伤认定的标准。然而，企业为了照顾员工情绪或出于其他考虑，配合员工将此次摔倒申请认定为工伤。一旦此事被劳动保障行政部门发现，企业将需要承担上述不实的工伤待遇费用，并可能面临行政处罚和信誉损失。
总结：企业应秉持诚信原则，严格遵守相关法律法规，确保工伤认定的真实性和准确性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。