结论前置：在仲裁材料中找不到劳动合同的情况下，协商解除劳动合同协议书是可以作为证据提供的，但具体能否被采纳以及其证明力的大小，需结合其他证据和案件具体情况综合判断。

一、协商解除劳动合同协议书的法律效力

协商解除劳动合同协议书是双方就解除劳动合同事宜达成一致意见后签订的书面文件，它具有法律效力，能够证明双方已经就解除劳动合同达成了共识。在劳动仲裁中，这份协议书可以作为证明劳动关系已经解除以及解除条件、方式等的重要证据。

二、提供协商解除劳动合同协议书的作用

1. 证明劳动关系解除：协议书明确记载了双方解除劳动合同的意愿和具体时间，是证明劳动关系已经解除的直接证据。
2. 明确解除条件：如果协议书中详细列明了解除劳动合同的条件，如经济补偿、工资结算等，这些条款将作为仲裁机构判断双方权利义务的重要依据。
3. 辅助其他证据：在缺乏劳动合同的情况下，协商解除劳动合同协议书可以与其他证据（如工资单、工作证、考勤记录等）相互印证，共同构建完整的证据链，证明劳动关系的存在和解除情况。

三、可能面临的挑战及应对建议

1. 协议书真实性争议：如果对方对协议书的真实性提出异议，仲裁机构可能会要求提供其他证据来佐证协议书的真实性。因此，在提供协议书时，应尽可能附上其他相关证据，如双方签字确认的会议纪要、邮件往来等。
2. 协议书内容完整性：如果协议书内容过于简略，没有详细列明解除劳动合同的条件和方式，可能会影响其证明力。因此，在签订协议书时，应尽可能详细、明确地记载双方的权利义务和解除条件。
3. 结合其他证据使用：在仲裁过程中，应尽可能提供其他与劳动关系相关的证据，如工资单、工作证、考勤记录等，以形成完整的证据链，提高仲裁胜诉率。

四、实际操作建议

1. 及时收集并整理证据：在发现劳动合同丢失后，应立即收集并整理其他与劳动关系相关的证据，包括协商解除劳动合同协议书、工资单、工作证等。
2. 咨询专业律师：在准备仲裁材料时，建议咨询专业律师的意见，以确保提供的证据充分、有效，并符合仲裁机构的要求。
3. 注意仲裁时效：根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。因此，在发现权益受到侵害后，应及时申请仲裁，以免错过时效期间。

最后，虽然协商解除劳动合同协议书在仲裁中可以作为证据提供，但具体能否被采纳以及其证明力的大小需结合其他证据和案件具体情况综合判断。如果你在准备仲裁材料过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。