《女职工劳动保护特别规定》并未作废，现行有效。以下是对此问题的详细分析：

1. 《女职工劳动保护特别规定》的发布与施行

   • 2012年4月18日，国务院第200次常务会议通过了《女职工劳动保护特别规定》，该规定旨在减少和解决女职工在劳动中因生理特点造成的特殊困难，保护女职工健康。
   • 此规定自公布之日起即开始施行，并明确废止了1988年9月1日起实施的《女职工劳动保护规定》。

2. 关于《女职工劳动保护规定》的废止情况

   • 需要澄清的是，存在一种误解认为《女职工劳动保护规定》仍然有效。实际上，被废止的是1988年7月21日由国务院发布的《女职工劳动保护规定》。
   • 这一旧版规定在2012年4月18日《女职工劳动保护特别规定》发布并施行时，已经被明确废止。因此，当前提及的《女职工劳动保护规定》若指的是1988年的版本，则是已经失效的法规。

3. 现行有效的相关法规

   • 目前，关于女职工劳动保护的主要法律依据是2012年发布的《女职工劳动保护特别规定》。该规定详细规定了女职工在经期、孕期、产期、哺乳期等特殊时期的劳动保护措施，以及用人单位应遵守的相关规定。
   • 此外，可能还存在其他根据社会发展变化进行修订或新制定的相关法规，这些法规共同构成了当前女职工劳动保护的法律体系。

4. 法律建议

   • 鉴于法律法规的不断更新和变化，建议企业和个人在涉及女职工劳动保护问题时，务必参考最新的法律法规，即2012年发布的《女职工劳动保护特别规定》，并咨询专业律师（如我）以获取准确的法律建议。
   • 同时，企业也应加强内部培训，确保相关人员对最新法律法规有充分的了解和掌握，以保障女职工的合法权益。

综上所述，《女职工劳动保护特别规定》是当前关于女职工劳动保护的主要法律依据，且并未作废。在处理相关问题时，应严格遵循现行有效的法律法规，并确保法律知识的准确性和时效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。