企业单位聘用人员超过两年未签订书面劳动合同或未依法处理劳动关系的，企业可能面临支付双倍工资、视为已订立无固定期限劳动合同等法律后果，需根据具体情况采取补救措施或承担相应责任。以下是具体分析：

1. 若未签订书面劳动合同

根据《劳动合同法》第八十二条及第十四条第三款规定：

• 双倍工资责任：用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资（最多11个月）；若超过一年仍未订立，则视为已订立无固定期限劳动合同，并需补签书面合同。
• 超两年后果：若用工已满两年仍未签订合同，企业需支付11个月双倍工资（已过仲裁时效的部分可能无法主张），且劳动者有权要求签订无固定期限劳动合同。

建议：企业应立即与劳动者补签书面无固定期限劳动合同，并协商补偿方案（如部分双倍工资），避免进一步纠纷。

2. 若未依法缴纳社保或公积金

根据《社会保险法》及《住房公积金管理条例》：

• 社保补缴义务：企业必须为劳动者补缴劳动关系存续期间的社会保险（养老、医疗、失业、工伤、生育），否则可能面临社保部门处罚及劳动者主张经济补偿的风险。
• 公积金补缴：部分地区（如北京、上海）规定公积金补缴不受时效限制，企业可能需补缴全部欠缴部分。

建议：企业应尽快核算欠缴金额，与劳动者协商补缴方案，或通过社保/公积金部门协调处理。

3. 若涉及事实劳动关系认定

若企业未与劳动者签订合同，但存在实际用工行为（如发放工资、安排工作），可能被认定为事实劳动关系：

• 劳动者权利：劳动者可主张未签合同的双倍工资、加班费、经济补偿等。
• 企业风险：若企业以“临时工”“非全日制”等理由否认劳动关系，需承担举证责任，否则可能败诉。

建议：企业应收集工资记录、考勤表、工作安排等证据，证明劳动关系性质，或通过协商明确双方权利义务。

4. 若劳动者主张经济补偿或赔偿

根据《劳动合同法》第三十八条、第四十六条：

• 劳动者解除权：若企业未依法缴纳社保、未签合同等，劳动者可解除劳动合同并主张经济补偿（按工作年限，每满一年支付一个月工资）。
• 违法解除赔偿：若企业违法解除劳动关系，需支付双倍经济补偿（即“2N”赔偿）。

建议：企业应避免单方解除劳动关系，若需调整用工方式，应与劳动者协商一致并签订书面协议。

5. 实务操作建议

1. 立即补签合同：与劳动者协商签订无固定期限劳动合同，明确权利义务。
2. 补缴社保公积金：核算欠缴金额，尽快完成补缴手续。
3. 协商补偿方案：针对双倍工资、经济补偿等诉求，与劳动者协商达成和解。
4. 完善用工制度：建立劳动合同管理台账，定期检查用工合规性，避免类似问题再次发生。

温馨提示：劳动法律问题具有地域性差异，具体操作需结合当地法规及司法实践。若您需要进一步分析或协助处理，可直接向我咨询，我将为您提供详细方案。