结论：进厂要签两个工资不一样的合同，是否合法不能一概而论，需要分情况讨论。
分析：
合同内容合法且双方自愿：
- 如果两个合同的内容均符合法律法规的规定，比如都明确了工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等关键条款，且双方是在平等、自愿的基础上签订的，那么即使两个合同的工资不一样，也是合法的。这种情况可能出现在，例如，一个合同是基本工资合同，另一个是奖金或提成合同，或者是因为工作性质、岗位不同而导致的工资差异。
存在欺诈、胁迫或显失公平：
- 如果其中一个合同的签订存在欺诈、胁迫等情形，或者合同内容显失公平，比如一个合同的工资远低于市场水平，且没有合理的解释或依据，那么这样的合同可能是无效的或可撤销的。在这种情况下，即使签订了两个合同，其中不合法的部分也是不受法律保护的。
违反法律法规强制性规定：
- 如果两个合同中的任何一个违反了法律法规的强制性规定，比如低于最低工资标准、未缴纳社会保险等，那么这样的合同是违法的，不受法律保护。即使另一个合同是合法的，也不能掩盖违法合同的事实。
法律建议：
- 仔细审查合同内容：在签订任何合同之前，都要仔细审查合同的内容，确保合同条款明确、合法，并且符合自己的利益。
- 咨询专业人士：如果对合同内容有疑问或不确定，可以咨询律师或相关领域的专业人士，以获取专业的意见和建议。
- 保留证据：在签订合同的过程中，要保留好相关的证据，比如合同文本、沟通记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
可能后果：
- 如果签订了不合法的合同，可能会面临工资无法按时足额支付、社会保险未缴纳等风险，甚至可能因此引发劳动纠纷或法律诉讼。
- 如果发现合同存在欺诈、胁迫或显失公平等情形，可以及时向相关部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
总之，进厂要签两个工资不一样的合同是否合法，取决于合同的内容、签订过程以及是否符合法律法规的规定。如果有任何疑问或不确定，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。