结论：公司内部制度规定员工在项目未完结时主动离职不发绩效工资，这一规定是否违法，需结合具体情况判断，若绩效工资属于员工固定劳动报酬的一部分，公司此规定违法；若绩效工资与项目完成情况挂钩且制度合法，则可能不违法。以下从不同角度详细分析：
一、绩效工资的性质
固定劳动报酬部分：
- 如果绩效工资是员工工资结构中的固定部分，与员工的工作表现、出勤情况等常规因素相关，而非单纯与项目完成情况挂钩，那么这部分绩效工资应视为员工应得的固定劳动报酬。
- 根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。因此，若绩效工资属于固定劳动报酬，公司不得以项目未完成为由拒绝支付。
与项目完成情况挂钩的奖励部分：
- 如果绩效工资明确与项目的完成情况、业绩指标等挂钩，且这部分工资在劳动合同或公司规章制度中有明确约定，那么它可能被视为一种奖励或浮动工资。
- 在这种情况下，如果员工在项目未完结时主动离职，且公司规章制度或劳动合同中明确规定了在此情况下不发绩效工资，且该规章制度经过民主程序制定并公示，那么公司的做法可能不违法。但需注意，规章制度的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定。
二、公司规章制度的合法性
制定程序合法：
- 公司的规章制度必须经过民主程序制定，即应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 规章制度制定后，还应当进行公示或者告知劳动者，以确保劳动者知悉其内容。
内容合法：
- 规章制度的内容不得违反法律法规的强制性规定，如不得设定低于最低工资标准的工资、不得违反工作时间和休息休假的规定等。
- 如果规章制度中关于不发绩效工资的规定违反了法律法规的强制性规定，那么该规定是无效的，公司不得以此为由拒绝支付绩效工资。
三、法律建议
对于员工：
- 在离职前，应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解自己的权益和义务。
- 如果认为公司不发绩效工资的做法违法，可以与公司协商解决；协商不成的，可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
对于公司：
- 在制定规章制度时，应确保制定程序合法、内容合法，并充分告知劳动者。
- 在处理员工离职和绩效工资发放问题时，应遵循法律法规的规定和劳动合同的约定，避免违法风险。
举例说明：假设某员工的工资结构中包括基本工资和绩效工资两部分，其中绩效工资与项目的完成情况挂钩。如果该员工在项目未完结时主动离职，且公司规章制度中明确规定了在此情况下不发绩效工资，且该规章制度经过民主程序制定并公示，那么公司的做法可能不违法。但如果绩效工资是员工固定劳动报酬的一部分，公司则不得以项目未完成为由拒绝支付。
后续行动建议：如果您或您所在的公司面临类似问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和解决方案。