关于得了传染病是否扣工资的问题，结论是：一般情况下，职工因患传染病请假或被隔离期间，单位不得无故扣减工资，但具体支付标准需根据实际情况确定。 以下是详细分析：
一、隔离治疗期与医学观察期
法律规定：
- 根据《中华人民共和国传染病防治法》第四十一条，被隔离人员有工作单位的，所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。这一规定适用于所有传染病，包括但不限于甲类、乙类传染病。
实践应用：
- 若职工因患传染病被政府或医疗机构要求隔离治疗或医学观察，期间单位应正常支付工资，不得扣减。这保障了职工在隔离期间的基本生活需求。
二、结束隔离后仍需停工治疗休养
医疗期规定：
- 若职工在隔离期结束后仍需停止工作进行治疗，则按照医疗期的相关规定支付病假工资。医疗期的确定依据职工实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
病假工资支付标准：
- 病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。例如，若当地最低工资标准为2000元，则病假工资最低不得少于1600元。
- 部分地区可能有更细致或严格的规定，如上海等地，劳动合同有约定的，按不低于劳动合同约定的劳动者本人所在岗位相对应的工资标准确定；集体合同标准高于劳动合同的，按集体合同标准确定。
三、灵活办公完成工作任务
灵活办公情形：
- 如果职工虽然身体不适但可以通过远程办公等方式完成工作任务，并与单位协商一致进行灵活办公，那么单位应当按照正常出勤支付工资。
实践建议：
- 在此情况下，职工应与单位保持良好沟通，明确工作任务和完成时间，确保工作质量和效率。同时，单位也应给予必要的支持和理解，共同维护良好的劳动关系。
四、特殊情形：工伤认定
工伤认定条件：
- 对于因工作原因感染传染病的职工，如医护及相关工作人员在履行工作职责中感染新型冠状病毒肺炎或因感染死亡，应认定为工伤。
工伤待遇：
- 若认定为工伤，职工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这进一步保障了职工在因工作原因感染传染病时的合法权益。
五、综合建议
了解法律法规：
- 职工应了解自己的合法权益，包括传染病期间的工资支付规定、医疗期规定等。这有助于职工在遇到问题时及时维护自己的权益。
与单位沟通：
- 若职工因患传染病需要请假或隔离治疗，应及时与单位沟通，明确工资支付标准和请假流程。这有助于避免不必要的纠纷和误解。
寻求法律帮助：
- 若单位违规扣减工资或拒绝支付工资，职工可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的权益。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和帮助。
总之，得了传染病并不意味着一定会扣工资。职工应根据自己的实际情况和法律法规的规定，与单位进行沟通并维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。