结论：单位因您父亲去世请假两天而扣工资的行为可能不合法，您有权要求单位补发工资，必要时可通过法律途径维权。

1. 从法律规定角度分析

根据《中华人民共和国劳动法》第五十一条规定：“劳动者在法定休假日和婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。”
丧假属于法定带薪假期，通常为1-3天（具体天数可能因地区或单位规定略有差异，但2天属于合理范围）。若您符合丧假条件（如直系亲属去世），单位无权扣减工资。
若单位扣工资，可能涉嫌违反《劳动法》和《工资支付暂行规定》，您有权要求单位补发工资，并可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

2. 从单位规章制度角度分析

若单位规章制度中明确规定“丧假需扣工资”，需注意两点：

• 合法性：单位规章制度不得与法律法规冲突，否则无效；
  
• 程序性：规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示，否则对您不产生约束力。
  若单位制度违法或未履行程序，您仍可主张工资权益。

3. 从实际操作角度建议

1. 收集证据：保留请假记录（如请假条、审批流程）、工资条、劳动合同等，证明单位扣工资的事实；
   
2. 与单位协商：向人事或上级说明法律规定，要求补发工资；
   
3. 投诉或仲裁：若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（通常15日内处理），或申请劳动仲裁（需在1年内提出）。
   

4. 特殊情况说明

• 非直系亲属：若去世亲属非直系（如祖父母、外祖父母），部分地区可能不强制要求带薪丧假，但单位仍需按规章制度或合同约定处理；
  
• 事假与丧假混淆：若单位以“事假”名义扣工资，但您实际符合丧假条件，可主张按丧假处理。
  

总结：单位扣工资的行为可能违法，您应优先通过协商解决，若无效可依法维权。如有进一步疑问或需具体操作指导，可直接向我咨询。