核心结论：面对包工头卷款跑路、工人来工地讨要工资的情况，甲方作为建设单位或发包方，需根据不同法律关系和实际情况采取相应措施，既要保障工人合法权益，也要维护自身利益。以下是具体分析和建议：

1. 明确甲方与工人、包工头的法律关系

• 若甲方与包工头为承揽/分包关系：
  根据《民法典》第791条，甲方将工程分包给包工头（实际施工人）时，若包工头拖欠工人工资，工人通常不能直接向甲方主张权利，除非甲方存在过错（如未支付工程款、选任无资质包工头等）。
  建议：

  • 立即核查与包工头的合同条款，确认是否约定“甲方直接支付工人工资”或“包工头需提供工资发放证明”；
    
  • 若合同未约定，要求工人提供与包工头的劳动关系证明（如劳动合同、考勤记录、工资条等），避免被认定为“事实劳动关系”而承担连带责任。

• 若甲方与工人存在直接或间接劳动关系：
  若工人能证明甲方直接雇佣（如通过包工头代发工资但实际受甲方管理），则甲方需按《劳动合同法》支付工资；若甲方将工程违法分包给无资质包工头，根据《保障农民工工资支付条例》第36条，甲方需承担清偿责任。
  建议：

  • 立即固定证据（如工人工作记录、甲方管理人员指令等），评估是否构成事实劳动关系；
    
  • 若构成，优先与工人协商支付方案，避免行政处罚（如人社部门责令限期支付、加付赔偿金）。

2. 立即采取的应急措施

• 核实包工头卷款事实：
  要求工人提供包工头卷款的证据（如转账记录、欠条、录音等），同时联系包工头核实情况。若包工头失联，可向公安机关报案（涉嫌拒不支付劳动报酬罪）。
  
• 安抚工人情绪，避免群体事件：
  工人聚集可能引发治安问题，甲方应派代表与工人沟通，承诺依法处理，并引导工人通过合法途径维权（如劳动监察投诉、仲裁或诉讼）。
  
• 暂停支付包工头剩余工程款：
  根据《保障农民工工资支付条例》第30条，若甲方未结清工程款，需在未结清范围内先行垫付工人工资，但可后续向包工头追偿。因此，暂停支付剩余款项可防止资金进一步流失。

3. 长期解决方案与风险防范

• 完善合同条款：
  未来与包工头签订合同时，明确约定“包工头需自行承担工人工资支付责任，并提供工资发放证明；若因包工头原因导致工人索赔，甲方有权从工程款中扣除并追偿”。
  
• 建立工资支付监管机制：
  要求包工头提供工人名单、工资表，并直接向工人账户发放工资（留存转账记录），避免包工头经手现金。
  
• 购买工程保险：
  投保“建筑工程一切险”或“雇主责任险”，转移因包工头跑路导致的经济风险。
  
• 法律追责：
  若包工头行为涉嫌犯罪（如诈骗、挪用资金），向公安机关报案；若仅是民事纠纷，可向法院起诉包工头，要求返还工程款并赔偿损失。

总结：甲方需根据法律关系快速响应，优先保障工人基本权益，同时通过合同条款、支付监管等手段防范风险。若情况复杂，可进一步提供具体合同、证据材料，我会为您制定更详细的应对方案。