关于工厂体检查乙肝五项是否合法的问题，这主要取决于体检的目的和背景，以及是否遵循了相关的法律法规。

首先，我们需要明确的是，在一般情况下，工厂在非特定工作岗位的体检中，将乙肝五项作为体检标准是不合法的。这一观点主要基于以下几点依据：

1. 法律法规的明确规定：

   • 根据《就业服务与就业管理规定》（劳动和社会保障部第28号令）第六十八条，用人单位在国家法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止乙肝病原携带者从事的工作岗位以外招用人员时，将乙肝病毒血清学指标作为体检标准的，由劳动保障行政部门责令改正，并可以处1000元以下的罚款。
   • 卫生部办公厅关于进一步规范乙肝项目检测的通知（卫办政法发〔2011〕14号）也明确指出，各级各类医疗机构在就业体检中，无论受检者是否自愿，一律不得提供乙肝项目检测服务。

2. 保护乙肝表面抗原携带者的权利：

   • 乙肝表面抗原携带者享有平等的就业权利，不应因携带乙肝病毒而受到歧视或限制。将乙肝五项作为体检标准，可能构成对乙肝表面抗原携带者的歧视，侵犯其合法权益。

3. 体检报告的保密性：

   • 即使进行乙肝项目检测（在特定情况下，如受检者本人主动要求），体检报告也应当完全密封，并由受检者本人或指定的人员领取，以保护受检者的隐私权。

然而，也需要注意到，在特定工作岗位，如食品加工、医疗卫生等可能涉及公共卫生安全的行业，国家可能规定乙肝病原携带者不得从事相关工作。在这种情况下，工厂进行乙肝项目检测可能是合法的，但必须严格遵循相关法律法规和程序，确保检测的合法性和必要性。

总结来说：

• 在非特定工作岗位的体检中，工厂将乙肝五项作为体检标准是不合法的，可能构成对乙肝表面抗原携带者的歧视。
• 在特定工作岗位，如涉及公共卫生安全的行业，国家可能规定乙肝病原携带者不得从事相关工作，此时进行乙肝项目检测可能是合法的，但必须严格遵循相关法律法规和程序。

如果您或您身边的人遇到类似问题，建议咨询当地劳动保障行政部门或法律专业人士，以获取更具体、更准确的法律建议。