关于工厂入职体检中是否可以包含乙肝两对半检测的问题，根据卫生部办公厅发布的《关于进一步规范乙肝项目检测的通知》（卫办政法发〔2011〕14号）及相关规定，我可以给出以下详细解答：
首先，明确结论：
在就业体检中，工厂或其他用人单位不得要求应聘者进行乙肝项目检测，包括乙肝两对半。这是为了切实维护乙肝表面抗原携带者的平等就业权利，防止因乙肝检测而产生的就业歧视。
接下来，详细解释相关规定：
医疗机构责任：
- 各级各类医疗机构在就业体检中，无论受检者是否自愿，一律不得提供乙肝项目检测服务。这是医疗机构必须严格遵守的规定，旨在保障应聘者的隐私权和就业平等权。
非就业体检情况：
- 如果受检者本人主动要求进行乙肝项目检测，并且非出于就业目的，医疗机构在妥善保存受检者签署的知情同意书后，可以提供检测服务。但检测结果报告应当独立于常规体检报告，以保护受检者的隐私。
体检报告领取与保密：
- 无论是就业体检还是其他体检，体检报告一律由受检者本人或受检者指定的人员领取。体检报告应当完全密封，并在显著位置注明仅限受检者本人拆阅，以确保体检信息的保密性。
违规处理：
- 地方各级卫生行政部门对收到的违规开展乙肝项目检测的投诉、举报等，会进行调查核实。凡查证属实、违反规定的，将予以通报批评，并依法依规严肃处理。情节严重的，还会对医疗机构主要负责人和直接责任人予以行政处分。
最后，给出建议：
- 如果您在入职体检中遇到工厂要求进行乙肝项目检测的情况，您有权拒绝并可以向当地卫生行政部门投诉举报。
- 同时，建议您了解并维护自己的合法权益，不要因乙肝检测而遭受不公平的就业待遇。
综上所述，工厂入职体检中不得包含乙肝两对半检测，这是为了保障应聘者的平等就业权利和隐私权。希望这个解答能够帮助您更好地理解相关规定并维护自己的权益。