公司检查乙肝两对半一般是不合法的，但在特定情况下可能存在例外。以下从不同角度为你详细分析：

常规情况下的不合法性

从法律法规层面来看，根据《就业促进法》以及《关于进一步规范入学和就业体检项目维护乙肝表面抗原携带者入学和就业权利的通知》等相关规定，用人单位在招用员工时，除国家法律、行政法规和卫生部规定禁止乙肝病原携带者从事的工作外，不得强行将乙肝病毒血清学指标作为体检标准，不得以劳动者携带乙肝表面抗原为由予以拒绝招（聘）用或辞退、解聘。也就是说，在一般的就业场景中，公司检查乙肝两对半属于侵犯劳动者隐私和就业平等权的行为，是不合法的。

例如，小李去一家普通企业应聘销售岗位，企业要求小李进行乙肝两对半检查，否则不予录用。这种情况下，企业的做法就违反了上述规定，小李有权拒绝该检查要求，并且可以向劳动监察部门投诉企业的违法行为。

可能的例外情况

虽然一般情况下公司检查乙肝两对半不合法，但在一些特殊行业和岗位，可能存在例外。比如，对于饮食、食品、饮用水生产经营人员、直接从事化妆品生产的人员等，根据《传染病防治法》及其实施办法等相关规定，这些岗位对从业人员的健康状况有特殊要求，需要排除患有某些传染病的情况，而乙肝属于传染病范畴，所以在这些特定岗位的入职体检中，可能会涉及乙肝相关的检查项目，但这也需要严格遵循相关法律法规的具体要求，不能随意扩大检查范围。

例如，小张应聘一家餐饮企业的厨师岗位，企业按照规定要求小张进行包括乙肝相关项目在内的健康检查，这是合法合理的。因为厨师的工作直接关系到食品安全和公众健康，需要确保其身体状况符合从事该岗位的要求。

劳动者应对建议

如果你遇到公司要求进行乙肝两对半检查的情况，首先可以明确拒绝该不合理要求，并向公司说明相关法律法规的规定。如果公司仍然坚持要求检查，你可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权对企业的违法行为进行查处，责令其改正，并可能对企业处以相应的罚款。同时，你也可以保留好相关证据，如公司的体检通知、与公司的沟通记录等，以便在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。

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