关于入职体检中肝功五项是否合法的问题，这主要取决于体检项目中是否包含了乙肝相关的检测。根据我国现行的法律法规和政策，入职体检中不得违法违规开展乙肝检测。

首先，国务院办公厅印发的《关于进一步做好高校毕业生等青年就业创业工作的通知》中明确指出，用人单位应根据工作岗位实际，合理确定入职体检项目，并不得违法违规开展乙肝、孕检等检测。这一规定旨在保护劳动者的就业权利，避免因为乙肝等健康状况而受到就业歧视。

其次，《就业服务与就业管理规定》以及《关于进一步规范入学和就业体检项目维护乙肝表面抗原携带者入学和就业权利的通知》等文件也进一步明确了取消入学、就业体检中的乙肝检测项目。这些规定强调，除国家法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止乙肝病原携带者从事的工作外，用人单位不得强行将乙肝病毒血清学指标作为体检标准。

对于肝功五项中的其他指标，如转氨酶等，这些通常是反映肝脏功能的基本指标，并不直接涉及乙肝病毒的检测。因此，在入职体检中检查这些指标是合法的，也是为了确保劳动者的身体健康状况符合工作岗位的要求。

总结来说：

1. 入职体检中不得违法违规开展乙肝检测，这是为了保护劳动者的就业权利，避免就业歧视。
2. 肝功五项中的其他指标（如转氨酶等）是反映肝脏功能的基本指标，检查这些指标是合法的。
3. 用人单位应根据工作岗位实际，合理确定入职体检项目，并遵守相关法律法规和政策规定。

如果您在入职体检中遇到了违法违规开展乙肝检测的情况，您可以向当地的劳动保障行政部门进行投诉和举报，以维护自己的合法权益。