工伤期间公司只发底薪是不合法的，职工在停工留薪期内应享受与原工资福利待遇相同的待遇。以下从多个角度为你详细分析：

法律依据

根据《工伤保险条例》第三十三条的明确规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”是一个全面的概念，它涵盖了职工在正常出勤情况下所获得的全部收入，包括但不限于基本工资、奖金、津贴和补贴等。

停工留薪期的时长与工资待遇

1. 时长：停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。
2. 工资待遇：在整个停工留薪期内，包括延长部分，工伤职工的工资待遇都应保持不变，即按照原工资福利待遇标准全额支付。

特殊情况的处理

虽然一般情况下工伤职工应享受全额工资福利待遇，但也存在某些特殊情况。例如，如果职工因工伤导致无法正常工作，需要进行劳动能力鉴定等，企业与职工可以协商一个较低的工资标准（但这必须基于双方的明确协商，并且企业的相关规定需符合法律法规的要求）。然而，这并不意味着企业可以单方面降低工伤期间的工资待遇。

劳动者的权益保护措施

如果发现用人单位在工伤期间仅发放底薪，劳动者可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 与公司协商：

   • 收集证据：首先，员工应收集能够证明工伤事实、工资水平以及工伤期间工作情况的相关证据，如工伤认定决定书、劳动合同、工资条、考勤记录等。
   • 友好沟通：主动与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确指出其工资支付不符合法律规定，并要求按照原工资福利待遇支付停工留薪期间的工资。建议保留沟通记录作为后续可能的法律程序中的证据。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 若与公司协商无果，员工可向当地人力资源和社会保障局内的劳动监察部门进行投诉。提交书面材料，详细说明工伤情况、单位发放工资的不合理情况等，并提供相关证据材料。
   • 劳动监察部门将依法进行调查处理，确保工伤员工的合法权益得到保障。

3. 申请劳动仲裁：

   • 如果劳动监察部门的处理结果仍不能令人满意，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁前，需准备好充分的证据材料，如工伤认定决定书、医疗诊断证明、工资发放记录等。
   • 仲裁委员会将根据双方提供的证据进行调解或裁决，确保公正处理。

4. 提起诉讼：

   • 如果对仲裁结果不服，员工还可以在规定的时间内向人民法院提起诉讼。通过司法途径维护自己的合法权益，要求用人单位依法支付工伤期间的工资待遇。

示例说明

假设某职工在工伤前每月工资为8000元（包括基本工资5000元、奖金2000元、津贴1000元），在工伤停工留薪期内，公司仅发放基本工资5000元。这种情况下，公司就违反了《工伤保险条例》的规定，职工有权要求公司补足剩余的3000元工资待遇。

总结：工伤期间公司只发底薪是违法的行为。作为劳动者，应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当措施来维护这些权益。如果你遇到类似问题或有其他法律疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。