结论：正式工和临时工的工资总额分开计算，关键在于明确两者的身份界定及工资构成，并依据相关法律法规和公司制度进行合理区分与核算。以下从不同角度详细阐述：
一、身份界定与工资构成
正式工：
- 身份界定：正式工通常与公司签订了长期的劳动合同，享有公司提供的稳定工作岗位和相应的福利待遇。
- 工资构成：正式工的工资总额一般包括基本工资、绩效工资、奖金、津贴、补贴等固定和浮动部分，这些部分通常都明确列在劳动合同中。
临时工：
- 身份界定：临时工则可能与公司签订的是短期或临时性的劳动合同，或者甚至没有签订书面合同，其工作性质往往是临时性的、非全日制的或特定项目制的。
- 工资构成：临时工的工资总额可能相对简单，主要包括按小时、按天或按项目计算的劳务报酬，可能不包含正式工所享有的那些固定和浮动工资部分。
二、工资总额分开计算的方法
依据劳动合同：
- 公司应首先依据与正式工和临时工签订的劳动合同，明确各自的工资构成和支付方式。
- 对于正式工，按照合同约定的工资总额进行核算和支付；对于临时工，则按照其实际提供的劳务时间和约定的报酬标准进行核算和支付。
建立独立核算体系：
- 公司可以建立独立的工资核算体系，分别记录正式工和临时工的工资发放情况。
- 这可以通过设置不同的工资账户、使用不同的工资发放表格或采用不同的工资管理系统来实现。
遵循相关法律法规：
- 在计算工资总额时，公司必须遵循国家相关的劳动法律法规，如《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等。
- 确保正式工和临时工的工资支付都符合最低工资标准、加班工资支付、社会保险缴纳等法律规定。
三、注意事项与建议
明确身份与合同：
- 公司应确保与每位员工都签订了合法有效的劳动合同，并明确其身份（正式工或临时工）和工资构成。
- 对于临时工，如果其工作性质符合非全日制用工的条件，公司应与其签订非全日制劳动合同，并按照相关规定支付工资。
透明化工资管理：
- 公司应建立透明化的工资管理制度，让员工清楚了解自己的工资构成和计算方式。
- 这有助于减少工资纠纷，提高员工满意度和忠诚度。
定期审计与核查：
- 公司应定期对工资发放情况进行审计和核查，确保工资总额的准确性和合法性。
- 如果发现任何问题或违规行为，应及时进行纠正和处理。
举例说明：假设某公司有正式工A和临时工B，A的月工资总额为8000元（包括基本工资5000元、绩效工资2000元、奖金1000元），B的日工资为200元，工作了10天。那么，在核算工资总额时，公司应分别支付A 8000元和B 2000元（200元/天 * 10天），并将这两部分工资分别记录在正式工和临时工的工资账户中。
后续行动建议：如果你在处理正式工和临时工的工资总额分开计算时遇到任何具体问题或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况提供详细的法律建议和解决方案。