工伤九级的员工三年后辞职，仍然有权获得一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金这两项补助金。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《工伤保险条例》第三十七条的规定，职工因工致残被鉴定为七级至十级伤残的，在劳动、聘用合同期满终止，或者职工本人提出解除劳动、聘用合同的情形下，由工伤保险基金支付一次性工伤医疗补助金，由用人单位支付一次性伤残就业补助金。这意味着，无论工伤发生后多久辞职，只要符合这一条件，员工都有权获得这两项补助金。

二、补助金的具体内容

1. 一次性工伤医疗补助金：

   • 支付主体：工伤保险基金。
   • 目的：用于补偿职工因工伤可能产生的后续医疗费用，如旧伤复发等。
   • 标准：具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，因此可能因地区而异。例如，某些地区可能规定为几个月的本人工资。

2. 一次性伤残就业补助金：

   • 支付主体：用人单位。
   • 目的：旨在帮助因工伤导致就业困难的职工重新就业，是对其经济损失的一种补偿。
   • 标准：同样由地方政府规定，如某些地区可能规定为几个月的本人工资。

三、注意事项

1. 地区差异：由于不同省份、直辖市、自治区对一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金的具体标准存在差异，因此赔偿金额会有所不同。员工在申领时应参照当地的具体规定。

2. 申请程序：为确保自身合法权益得到保障，员工应按规定程序办理相关补偿申领手续。这通常包括向工伤保险经办机构或用人单位提交工伤认定书、伤残等级鉴定书、辞职证明等相关材料。

3. 法律保障：如果用人单位未依法支付相关赔偿，员工可以向劳动行政部门投诉或依法申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

四、实际案例与操作建议

在实际操作中，员工应首先确认自己的工伤等级和辞职时间是否符合领取补助金的条件。然后，按照当地工伤保险政策规定的流程，向相关部门提交申请材料。如果遇到任何问题或困难，可以寻求法律援助或咨询专业律师（即我本人，何青松律师，专注于经济纠纷、合同纠纷、房产纠纷、刑事辩护、公司事务、劳动纠纷、婚姻家庭领域）以获取更具体的指导和帮助。

综上所述，工伤九级的员工三年后辞职时，仍然有权获得一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。