结论：公司扣销售人员样品费是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及劳动合同约定、公司规章制度合法性以及费用扣除的合理性三个方面。以下从这三个角度进行详细分析：
一、劳动合同约定
有明确约定：如果销售人员与公司签订的劳动合同中明确约定了样品费由销售人员承担，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣除样品费的行为通常是合法的。这种情况下，销售人员应当按照合同约定履行义务。
无明确约定：如果劳动合同中没有明确约定样品费由销售人员承担，那么公司单方面扣除样品费可能缺乏合同依据，此时需要进一步分析公司规章制度和费用扣除的合理性。
二、公司规章制度合法性
规章制度合法且经民主程序制定：如果公司规章制度中明确规定了样品费的扣除方式和标准，且该规章制度经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论通过），并向劳动者进行了公示或告知，那么该规章制度对销售人员具有约束力。在这种情况下，公司扣除样品费的行为可能是合法的。
规章制度不合法或未经民主程序制定：如果公司规章制度中关于样品费扣除的规定违反了法律法规的强制性规定，或者未经民主程序制定，未向劳动者进行公示或告知，那么该规章制度对销售人员不具有约束力。此时，公司扣除样品费的行为可能缺乏合法依据。
三、费用扣除的合理性
费用实际发生且合理：即使劳动合同或公司规章制度中规定了样品费的扣除，公司也需要证明该费用确实已经发生，并且扣除的金额是合理的。如果公司无法提供充分的证据证明费用实际发生或扣除金额不合理，那么销售人员有权要求公司返还被扣除的费用。
未造成销售人员生活困难：根据相关法律法规，公司在扣除劳动者工资时，需要确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准，且不会造成劳动者生活困难。如果扣除样品费导致销售人员工资低于最低工资标准或造成其生活困难，那么公司扣除样品费的行为可能违法。
建议：
对于销售人员而言，如果公司扣除样品费，首先应查看劳动合同和公司规章制度中是否有相关约定或规定。如果存在争议，可以与公司协商解决；协商不成的，可以向劳动争议调解委员会申请调解或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
对于公司而言，在制定规章制度或签订劳动合同时，应明确样品费的承担方式和标准，并确保相关条款合法有效。同时，在扣除样品费时，应确保费用实际发生且扣除金额合理，避免侵犯销售人员的合法权益。
后续思考：在实际操作中，公司扣除销售人员样品费的问题可能涉及多个方面，包括合同约定、规章制度合法性、费用扣除合理性等。因此，在处理此类问题时，需要综合考虑各种因素，确保公司的行为合法合规。如果销售人员或公司对此类问题存在疑问或争议，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。