结论：公司因您年前请了十二天假就扣除一个月十三薪的做法，是否违法不能一概而论，需要结合您与公司签订的劳动合同、公司规章制度以及请假性质等多方面因素来综合判断。
分析：
劳动合同与规章制度：
- 首先，要查看您与公司签订的劳动合同中是否有关于十三薪发放的具体规定。如果合同中明确规定了十三薪的发放条件，且您未满足这些条件（如请假超过一定天数），那么公司扣除十三薪可能有一定的合同依据。
- 其次，要审查公司的规章制度。如果公司规章制度中明确规定了请假与十三薪发放的关系，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，那么公司按照规章制度执行也是合法的。
请假性质：
- 请假的性质也会影响公司扣除十三薪的合法性。如果您请的是病假、年假等法定假期，且符合相关法律法规的规定，那么公司扣除十三薪可能缺乏合法依据。
- 如果您请的是事假，且公司规章制度或劳动合同中明确规定了事假与十三薪发放的关系，那么公司扣除十三薪可能是合法的。但即便如此，公司扣除的金额也应当合理，不能随意扩大扣除范围。
法律原则：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。十三薪作为劳动报酬的一部分，也应当受到法律保护。
- 如果公司扣除十三薪的行为缺乏合同依据或规章制度支持，且违反了法律法规的规定，那么该行为就是违法的。
建议：
- 与公司沟通：首先，您可以尝试与公司进行沟通，了解公司扣除十三薪的具体原因和依据。如果公司能够提供合理的解释和依据，且您认可这些解释和依据，那么问题可能得到妥善解决。
- 申请劳动仲裁：如果公司无法提供合理的解释和依据，或者您不认可公司的解释和依据，那么您可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 咨询专业律师：在处理此类纠纷时，如果您感到困惑或无法自行解决，可以向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和帮助。
可能后果：
- 如果公司扣除十三薪的行为被认定为违法，那么公司可能需要向您支付被扣除的十三薪以及可能的赔偿金。
- 如果您因此与公司产生纠纷并申请劳动仲裁或提起诉讼，那么您需要准备相关证据来支持自己的主张，如劳动合同、公司规章制度、请假记录等。