结论：公司因平时加班不够扣而扣双倍加班费的做法，一般是不合法的。以下从多个角度进行分析：
法律角度
加班费支付规定：
- 根据《劳动法》及相关规定，用人单位安排劳动者加班的，应当按照国家有关规定支付加班费。加班费的具体支付标准通常根据加班的时间和性质来确定，如工作日加班、休息日加班和法定节假日加班的支付标准各不相同，但均未规定可以因加班不够而扣双倍加班费。
工资支付原则：
- 工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位应当按时足额支付。任何克扣或者无故拖欠劳动者工资的行为都是违法的。因此，公司因加班不够而扣双倍加班费，实际上是对劳动者工资的克扣，违反了工资支付原则。
实际操作角度
加班管理：
- 公司应当建立合理的加班管理制度，明确加班的申请、审批和记录流程。如果劳动者未按照公司规定加班，公司可以通过其他方式（如警告、扣减绩效等）进行管理，但不应直接扣减加班费，更不应扣双倍加班费。
员工权益保护：
- 劳动者有权获得与其劳动相应的报酬。如果公司因加班不够而扣双倍加班费，劳动者可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
可能的法律后果
行政处罚：
- 如果公司因加班不够而扣双倍加班费的行为被劳动监察部门查实，公司可能会面临行政处罚，如罚款、责令改正等。
民事赔偿：
- 如果劳动者因此遭受损失，如工资被克扣导致生活困难等，公司还可能需要承担民事赔偿责任，赔偿劳动者的实际损失。
建议：
- 对于公司而言，应当遵守国家法律法规，建立合理的加班管理制度和工资支付制度，确保劳动者的合法权益得到保障。
- 对于劳动者而言，如果遇到公司因加班不够而扣双倍加班费的情况，应当及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。同时，也可以咨询专业律师（如我，甘洪博律师，专注于劳动纠纷等领域），获取更具体的法律建议和帮助。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。