职工辞职三个月后又入职的，劳动关系自新入职之日起重新确认。具体分析如下：

1. 劳动关系重新建立
   根据《劳动合同法》第七条，劳动关系自用工之日起建立。职工辞职后，原劳动关系已依法终止；三个月后重新入职的，无论是否在原岗位或原用人单位，均视为新的用工关系，需重新签订劳动合同、确认权利义务。
   法律依据：《劳动合同法》第十条明确，建立劳动关系应当订立书面劳动合同，已建立劳动关系未同时订立的，应当自用工之日起一个月内补订。

2. 连续工龄的认定需区分情形

   • 原单位再次录用：若职工辞职后未与其他单位建立劳动关系，且原单位同意重新录用，部分地区（如广东、江苏）的司法实践可能将辞职前的工龄与新入职工龄合并计算，用于经济补偿、年休假等权益。但需满足以下条件：
     
     • 原单位未支付经济补偿；
       
     • 双方约定或地方性法规明确支持工龄连续计算；
       
     • 职工未出现严重违反规章制度等中断就业的情形。
       
   • 新单位入职：若职工入职新用人单位，原工龄不连续计算，新单位需独立承担用工责任（如社保缴纳、经济补偿等）。

3. 实务建议

   • 对用人单位：
     
     • 重新入职时，务必签订书面劳动合同，明确试用期、岗位、薪酬等条款，避免因未签合同支付双倍工资（《劳动合同法》第八十二条）；
       
     • 若需连续计算工龄，应在劳动合同或补充协议中明确约定，并留存职工原离职手续、未领取经济补偿的证明等材料。
       
   • 对职工：
     
     • 主动要求签订书面合同，确认工龄计算方式；
       
     • 保留原单位离职证明、工资记录等证据，以备维权时使用。

总结：重新入职后，劳动关系自新用工之日起独立建立，工龄是否连续需结合地方规定和双方约定。如有具体争议，建议提供离职协议、新合同等材料进一步分析。