针对您提出的问题，结合劳动争议处理的相关法律规定，现分情况说明如下：

1. 公司乱扣绩效问题
   根据《劳动合同法》第三十八条及《工资支付暂行规定》第十五条，用人单位不得克扣或无故拖欠劳动者工资。若公司存在未通过民主程序制定绩效考核制度、未公示考核标准、考核结果未与劳动者确认等情形，则属于违法克扣工资。
   处理路径：
   

• 前置程序：需先向公司提出书面异议（保留送达证据），若公司拒绝改正，再申请劳动仲裁；
  
• 仲裁请求：可主张补发工资差额、加付50%-100%赔偿金（需劳动行政部门责令后仍不支付），并可依据《劳动合同法》第三十八条主张被迫解除劳动合同并要求经济补偿。

1. 社保按最低基数缴费问题
   根据《社会保险法》第六十条，用人单位应按职工实际工资申报社保缴费基数。若公司未如实申报导致劳动者权益受损（如养老金、医保待遇降低），属于违法行为。
   处理路径：
   

• 行政投诉优先：向当地社保稽核部门举报（如社保中心征缴科），要求核查缴费基数并责令补缴；
  
• 仲裁衔接：若因社保缴费基数争议导致劳动合同解除（如公司拒不改正），可同步申请劳动仲裁主张经济补偿，但社保补缴本身需通过行政程序处理。

1. 不缴纳公积金问题
   根据《住房公积金管理条例》第三十八条，单位不缴或少缴住房公积金的，由住房公积金管理中心责令限期缴存。
   处理路径：
   

• 专属救济渠道：直接向当地住房公积金管理中心投诉（如公积金管理中心执法处），该争议不属于劳动仲裁受理范围；
  
• 特殊情形：若因公积金问题导致劳动合同解除，可依据《劳动合同法》第三十八条主张经济补偿，但需证明公积金问题构成”未按照劳动合同约定提供劳动条件”。

综合建议：

1. 优先通过书面形式向公司提出异议并留存证据（如EMS邮寄、邮件沟通）；
   
2. 针对社保问题向社保稽核部门投诉，公积金问题向公积金管理中心投诉；
   
3. 若公司存在多项违法行为且拒不改正，可依据《劳动合同法》第三十八条发送《被迫解除劳动合同通知书》后申请仲裁，主张工资差额、经济补偿等；
   
4. 仲裁时效为知道或应当知道权利受损之日起1年，建议尽快启动程序。
   

如需进一步分析具体证据材料或起草法律文书，可提供详细信息后为您定制解决方案。