员工因刑事案件被拘留，单位以严重违反公司规章制度为由解除劳动合同，这一行为是否合法，需分情况讨论：

1. 员工被刑事拘留但未判刑

   • 基本原则：员工被刑事拘留并不等同于被依法追究刑事责任。刑事拘留只是一种刑事强制措施，并非最终的有罪判决。因此，在员工仅被刑事拘留的阶段，其是否有罪尚不确定，公司通常不可以直接解除劳动合同。
   • 规章制度依据：除非公司的规章制度中有明确规定，员工因被刑事拘留而长期无法正常履行工作职责属于严重违反公司规章制度，并且公司已经经过合法的程序（如公示规章制度、与工会沟通等），否则公司不能以此为由解除劳动合同。若公司违法解除劳动合同，需按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
   • 特殊情况：如果员工的劳动合同中有特别规定，或者公司能证明员工严重违反了公司规定且与被拘留这事儿没关系（比如员工在被拘留前已经存在多次严重违反公司规章制度的行为），那么公司也可能有合法理由解除劳动合同。但这种情况较为特殊，需要具体证据支持。

2. 员工被判刑

   • 法律依据：若员工经过法院审判，最终被认定有罪并承担刑事处罚（如被判处拘役、有期徒刑、缓刑等刑罚），则公司可以依据《劳动合同法》的规定来解除劳动合同。因为此时员工已经被依法追究刑事责任，符合《劳动合同法》第三十九条中用人单位可以解除劳动合同的情形。

3. 公司处理建议

   • 谨慎处理：鉴于每个情况的具体性和复杂性，公司在面对员工被刑事拘留的情况时，应谨慎处理。不要急于解除劳动合同，以免面临违法解除的法律风险。
   • 咨询法律意见：在处理此类问题时，公司可以向我咨询具体的法律意见。我会根据公司的规章制度、员工的实际情况以及相关法律法规，为公司提供合法、合理的处理建议。
   • 遵循法定程序：如果公司决定解除劳动合同，必须确保遵循法定程序。比如，如果公司以员工严重违反规章制度为由解除劳动合同，需要确保规章制度已经经过合法程序制定并公示，且解除劳动合同的决定已经通知工会或职工代表大会等。

总结来说，员工因刑事案件被拘留时，公司能否以严重违反公司规章制度为由解除劳动合同，需根据员工是否被判刑以及公司规章制度的具体规定来判断。在大多数情况下，如果员工仅被刑事拘留而未被判刑，公司不能直接解除劳动合同。如果公司面临此类情况或有任何疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律意见。